Structure and function of sex chromosomes in the model dioecious plant, Silene latifolia
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium struktury a funkce pohlavních chromozómů Silene latifolia
Annotation in Czech
Silene latifolia (syn. Melandrium album, knotovka bílá)je dvoudomou rostlinou s heteromorfními pohlavními chromozómy (2n = 24, X,Y; typ savčí). Vzhledem k velikosti těchto chromozómů a vyrazné homologii sekvencí na chromozómech X a Y je předpoklad, že sevyvinuly relativně recentně. V průběhu posledních několika let naše laboratoř získala řadu unikátních poznatků o struktuře pohlavních chromozómů knotovky a epigenetické podmíněnosti dvoudomosti. Předkládaný projekt se bude zabývat zejména (i) genetickýmmapováním chromozómu X u S. latifolia založeným na studiu rekombinačních frekvencí tří genů (S1X1, 3 a 4) metodou PCR se sekvenční a resktrikční analýzou a analogickým mapováním těchto genů u příbuzných gynodioecických a hermafroditických druhů Silene, sekce Elisanthe (2n = 24), s cílem identifikovat jejich vazebné skupiny a tím i původ pohlavních chromozómů z páru autozómů, a (ii) úlohou sex-specifických metylací homologních sekvencí DNA na pohlavních chromozómech X a Y (metodou genomového
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
GE - Plant cultivation
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Silene latifolia is a key plant model to study sex determination and chromosome evolution. Our current studies have been based on physical and genetic mapping of the sequences linked to sex chromosomes with analysis of their characters and relative posit
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
3,952 thou. CZK
Public financial support
2,947 thou. CZK
Other public sources
1,005 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK