Isolation of Sex Linked Genes to Study Evolution of Sex Chromosomes in Plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
522-09-0083
Alternative language
Project name in Czech
Izolace genů vázaných na pohlavní chromozomy a jejich využití ke studiu evoluce pohlavních chromozomů u rostlin
Annotation in Czech
Existence pohlavního rozmnožování jako strategie pro udržování genetické variability reprezentuje jeden ze základních problémů současné biologie. Pohlavní chromozomy se vyvinuly během evoluce nezávisle, a to jak u živočichů, tak u rostlin. V tomto projektu budeme identifikovat a charakterizovat nové geny, které jsou vázány na pohlavní chromozomy silenky šírolisté (Silene latifolia), která představuje modelový druh pro studium rané fáze evoluce pohlavních chromozomů. K tomuto účelu jsme vytvořili unikátní metodu založenou na hybridizaci cDNA na membránu imobilizované chromozomy X. Paralelně používáme BAC knihovnu S. latifolia k identifikaci nových genů vázaných na pohlavní chromozomy. Navržená studie pomůže odhalit, které mechanizmy evoluce pohlavních chromozomů (např. dávková kompenzace genů, degenerace genů v nerekombinujících částech pohlavních chromozomů, přenos genů z autozomů na pohlavní chromozomy) mají obecný charakter. Projekt je přímým pokračováním grantu GAČR (521/06/0056) a bude realizovánv úzké spolupráci s Institute of Integrative Biology (ETH, Zürich, Switzerland).
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Within the project original structural and functional characteristics of sex chromosomes of Silene latifolia including so-called PAR region were obtained. In addition, comparative genomic analyses were performed involving another model Rumex acetosa. Theproject work was published in seven impact publications and as a book chapter. All budget changes were substantiated.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 6, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
5,194 thou. CZK
Public financial support
5,194 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK