Biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry and identification of protein markers of infection
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
FP6-2002-Mobility-12
Main participants
—
Contest type
RP - Co-financing of EC programme
Contract ID
MSMT-2956/2012-36
Alternative language
Project name in Czech
Biotypizace fytopatogenů kulturních rostlin pomocí hmotnostní spektrometrie a identifikace proteinových markerů infekce
Annotation in Czech
Plísně jsou původci onemocnění důležitých plodin. Jejich diagnostika je založena na specifičnosti hostitele, symptomech a mikroskopii. V poslední době jsme se v rámci společného týmu věnovali alternativnímu postupu založeném na hmotnostní spektrometrii intaktních buněk plísní. Je třeba pouze malého množství materiálu a využívá se jednoduchého zpracování vzorku a rychlé interpretace dat. Na dvou modelových patogenech byla vypracována metodika přípravy vzorku a postup měření. Pro řadu mikroorganismů jsmezískali knihovnu proteinových spekter, která je k dispozici pro taxonomickou identifikaci izolátů z terénních sběrů. V rámci pokračovacího projektu chceme dokončit vývoj metodiky pro biotypizaci rostlinných patogenů měřením přímo z infikovaného materiálu(listy, stonek), což umožní rychlou, levnou a spolehlivou diagnostiku. Studované mikroorganismy budou rozšířeny o patogeny chmele a vinné révy. Důkladnou analýzou povrchových proteinů patogenů bychom rovněž chtěli odhalit biomarkery infekce.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project is being realized in the framework of the MOBILITY Activity that aims primarily on establishing and strenghtening ties with foreign research institutions. The control of particular outputs is not implemented by the evalution committee, but the correctness of allocated finances and the adequacy of their use are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 18, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-MSM-7A-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2014
Finance
Total approved costs
140 thou. CZK
Public financial support
140 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK