All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry and identification of protein markers of infection

Public support

  • Provider

    Ministry of Education, Youth and Sports

  • Programme

  • Call for proposals

    FP6-2002-Mobility-12

  • Main participants

  • Contest type

    RP - Co-financing of EC programme

  • Contract ID

    MSMT-2956/2012-36

Alternative language

  • Project name in Czech

    Biotypizace fytopatogenů kulturních rostlin pomocí hmotnostní spektrometrie a identifikace proteinových markerů infekce

  • Annotation in Czech

    Plísně jsou původci onemocnění důležitých plodin. Jejich diagnostika je založena na specifičnosti hostitele, symptomech a mikroskopii. V poslední době jsme se v rámci společného týmu věnovali alternativnímu postupu založeném na hmotnostní spektrometrii intaktních buněk plísní. Je třeba pouze malého množství materiálu a využívá se jednoduchého zpracování vzorku a rychlé interpretace dat. Na dvou modelových patogenech byla vypracována metodika přípravy vzorku a postup měření. Pro řadu mikroorganismů jsmezískali knihovnu proteinových spekter, která je k dispozici pro taxonomickou identifikaci izolátů z terénních sběrů. V rámci pokračovacího projektu chceme dokončit vývoj metodiky pro biotypizaci rostlinných patogenů měřením přímo z infikovaného materiálu(listy, stonek), což umožní rychlou, levnou a spolehlivou diagnostiku. Studované mikroorganismy budou rozšířeny o patogeny chmele a vinné révy. Důkladnou analýzou povrchových proteinů patogenů bychom rovněž chtěli odhalit biomarkery infekce.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - secondary branch

    EF - Botany

  • CEP - another secondary branch

    GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    This project is being realized in the framework of the MOBILITY Activity that aims primarily on establishing and strenghtening ties with foreign research institutions. The control of particular outputs is not implemented by the evalution committee, but the correctness of allocated finances and the adequacy of their use are checked.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2012

  • Realization period - end

    Dec 31, 2013

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Feb 18, 2013

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP14-MSM-7A-U/01:1

  • Data delivery date

    Jun 30, 2014

Finance

  • Total approved costs

    140 thou. CZK

  • Public financial support

    140 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK