All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Identification and biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry

Public support

  • Provider

    Ministry of Education, Youth and Sports

  • Programme

    KONTAKT

  • Call for proposals

  • Main participants

  • Contest type

    M2 - International cooperation

  • Contract ID

    7535/2010-32

Alternative language

  • Project name in Czech

    Identifikace a biotypizace fytopatogenů kulturních rostlin pomocí hmotnostní spektrometrie

  • Annotation in Czech

    Plísně jsou obligátními biotrofními patogeny rostlin, které způsobují vážná onemocnění ekonomicky důležitých plodin. Jejich současná diagnostika je založena na kombinaci specifičnosti hostitele, symptomech a mikroskopii. Ačkoli bývá význam fenotypových rysů diskutován, mikroskopická pozorování zůstávají nenahraditelnými. Tato metoda je však silně závislá na praxi a zkušenostech fytopatologa. Navrhujeme vypracovat alternativní přístup založený na hmotnostní spektrometrii, která vyžaduje pouze malé množství materiálu a přitom využívá velmi rychlého a relativně jednoduchého zpracování vzorku a interpretace dat. Vyhledávání v databázi založené na porovnávání typických a neznámých hmotnostních spekter umožňuje identifikaci a taxonomickou klasifikaci mikroorganismů např. analýzou hlavních komponent. Většina plánovaných experimentů bude založena na hmotnostně spektrometrické analýze povrchových proteinů uvolněných působením kyseliny na rostlinné patogeny. V rámci projektu se předpokládá předání know-how rak

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - secondary branch

    EF - Botany

  • CEP - another secondary branch

    CB - Analytical chemistry, separation

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    An alternative diagnostic approach for fungal phytopathogens was investigated utilizing intact spore MALDI-TOF mass spectrometry. Experimental work involved optimization of sample preparation method and measurements from infected host?s leaves.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2010

  • Realization period - end

    Dec 31, 2011

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 21, 2011

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP12-MSM-ME-U/01:1

  • Data delivery date

    Jul 12, 2012

Finance

  • Total approved costs

    160 thou. CZK

  • Public financial support

    160 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK