Developent of a technique for the quantification of fungal pathogens based on Real-Time PCR approach.
Public support
Provider
Ministry of Agriculture
Programme
Scheme I
Call for proposals
Program I (SMZE2001_1_1)
Main participants
Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.<br>Zemědělský výzkumný ústav Kroměříž, s.r.o.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj metody pro kvantifikaci houbových patogenů na bázi RealTime PCR
Annotation in Czech
Real Time PCR je jednou z moderních technik, která umožňuje kvantitativně stanovit přítomnost určitého typu DNA/mRNA templátu. Jednou z možností aplikace této metody je i kvantifikace přítomnosti houbového patogena v listových pletivech. Tato informacejevýznamná pro studium interakce patogen - hostitel pro stanovení stupně napadení a v některých případech také následně i pro stanovení kvantity patogena v odvozených produktech (potravinách). V rámci projektu budou na modelu Drechslera terez optimalizovány jednotlivé kroky, které vedou k přípravě metodiky založené na využití TaqMan sond pro kvantifikaci. TaqMan sondy budou odvozeny z druhově specifických sekvencí získaných analýzou souboru monosporidiálních kultur a příslušných kontrol příbuznýchdruhů metodou AFLP a analýzou vybraných publikovaných sekvencí patogena. Současně bude získán částečný přehled o výskytu forem patogena v ČR a o jeho proměnlivosti. Jedná se o vysoce moderní přístup k řešení této problematiky
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Průběh řešení a výsledky odpovídají smlouvě. Cíl byl naplněn, požadované výstupy byly zpracovány. Zpracovaná metodika molekulární diagnostiky houbových patogenů zvyšuje přesnost diagnostiky proti stávajícím metodám.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2001
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-MZE-QC-U/04:1
Data delivery date
Jun 29, 2006
Finance
Total approved costs
3,000 thou. CZK
Public financial support
3,000 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK