Microbial diversity in Patagonian soils under different land use and pollution sources
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
MSMT-10040/2015-1
Alternative language
Project name in Czech
Mikrobiální diversita v patagonských půdách s různým využitím a pod vlivem různých polutantů
Annotation in Czech
(i) Stanovit strukturu mikrobiálních komunit v půdních vzorcích z povodí Río Negro a určit vztah mezi mikrobiální diversitou a využíváním půd, jejich vlastnostmi, mírou znečištění a toxicitou. Cílu bude dosaženo pomocí moderních technik mikrobiální ekologie, především pyrosekvenační analýzou 16S rRNA genů, jak je popsáno v našich dřívějších pracích (Uhlík et al. PLoS ONE 2012, 7: e40653; Uhlík, Musilová et al. Appl Microbiol Biot 2013, 97: 9245-9256) a agrochemických analýz půdních vzorků včetně koncentrací polutantů, které budou prováděny podle protokolů popsaných kolegy v laboratoři v Argentině (Miglioranza, Gonzalez et al. Sci Total Environ 2013, 452-453: 275-285), a analýz toxicity půdních vzorků (Macek et al. Minotaurus Handbook, v tisku). (ii) Kultivace, izolace a charakterizace bakteriálních populací/komunit degradujících DDT ze vzorků kontaminovaných DDT. Vědeckých prací, které zmiňují bakterie degradující DDT, je stále velice málo. Doposud nebyly izolovány žádné kmeny efektivně degradující tento polutant. Výhodou půd v povodí Río Negro je, že zde byly pesticidy včetně DDT aplikovány opakovaně a ve velkých množstvích. Naší hypotézou je, že půdní bakteriální populace si vyvinuly strategie jak se s přítomností tohoto pesticidu či jeho oxidativních metabolitů vyrovnat, ideálně je degradovat. Cíle bude dosaženo s pomocí tradičních metod přímé extrakce či nabohacovací kultivace, jak je popsáno pro další POP (Uhlík, Strejček et al. Appl Environ Microbiol 2011, 77: 6858-6866; Kurzawová, Štursa, Uhlík et al. New Biotechnol 2012; 30: 15-22).
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EH - Ecology - communities
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
DK - Contamination and decontamination of soil including pesticides
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10511 - Environmental sciences (social aspects to be 5.7)<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project was being realized in the framework of the MOBILITY Activity that aims primarily on establishing and strenghtening ties with foreign research institutions. The control of particular outputs is not implemented by the evalution committee, but the correctness of allocated finances and the adequacy of their use are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 2, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-MSM-7A-U/02:1
Data delivery date
Jun 8, 2018
Finance
Total approved costs
320 thou. CZK
Public financial support
320 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK