Bacterial communities involved in biogeochemical cycling in forest soils: from the roots to the litter
Project goals
Globální carbon cycle is in the focus of current research due to the assumptions that climate change may substantially modify the flow of carbon in the ecosystem. Boreal and temperate coniferous forests represent an important terrestrial biome that stores large amounts of C and where bacteria are assumed to mediate key ecosystem services. However, the current understanding of the functional roles of baceria and their communities and interaction with C pools is limited. In this project, the composition of bacterial communities in forest soils and its determinants will be characterised and attention will be paid on their with the consideration of the seasonality of C flow in forest ecosystems. Through the coordinated analysis of soil metabolomes, bacterial communities, individual taxa and their activity as demonstrated in the metatranscriptome and metaproteome, the involvement of bacteria in ecosystem processes across the root - rhizosphere – soil – litter continuum will be described in temperate and boreal forests differing in nitrogen content.
Keywords
carbon cycleplant-bacterial interactionsseasonalityomicsbacterial communitymicrobial ecologyforest soil
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-25706S
Alternative language
Project name in Czech
Společenstva bakterií, účastnící se biogeochemických procesů v lesních půdách: od kořenů po opad
Annotation in Czech
Globální cyklus uhlíku je předmětem zájmu v souvislosti s tím, že klimatické změny mohou tok uhlíku v ekosystému zásadně změnit. Boreální a temperátní jehličnaté lesy představují významný terestrický biom, kde jsou skladována velká množství C, a kde bakterie zprostředkují klíčové ekosystémové služby. Současné porozumění funkčním úlohám bakteriálních společenstev a jejich interakcím se zásobárnami půdního C je však velmi omezené. V tomto projektu bude charakterizováno složení bakteriálních komunit v lesních půdách a jeho determinanty a bude věnována pozornost jejich fungování s ohledem na sezónnost toků uhlíku v lesním ekosystému. Prostřednictvím koordinované analýzy půdních metabolitů, společenstev bakterií a jednotlivých isolátů a jejich aktivity, demonstrované v metatranskriptomu a metaproteomu, bude podrobně popsána účast bakterií na ekosystémových procesech v kontinuu kořen - rhizosféra - půda - opad v temperátních a boreálních lesích, lišících se obsahem dusíku.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Mar 25, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
8,906 thou. CZK
Public financial support
8,873 thou. CZK
Other public sources
33 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
8 906 CZK thou.
Public support
8 873 CZK thou.
99%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Ecology
Solution period
01. 01. 2018 - 31. 12. 2022