Evolution of alpine ecotypes in plant model Arabidopsis arenosa
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
FP6-2002-Mobility-1
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
RP - Co-financing of EC programme
Contract ID
MSMT-502/2016-1
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce horských ekotypů rostlinného modelu Arabidopsis arenosa.
Annotation in Czech
Výzkumné (min. 2 publikace v SCI časopisech) Hlavním cílem projektu je odhalit interakce vnitřních a vnějších faktorů v evoluci rostlinných ekotypů, konkrétně do jaké míry horské fenotypy A. arenosa důsledkem (opakované) adaptace na horské prostředí, a do jaké míry fenotypickou plasticitou? I. Kolikrát kolonizoval tetraploidní cytotyp vysokohorská stanoviště? Hypotéza: Genetická struktura bude odpovídat spíše geografii, indikující nezávislou kolonizaci v rámci každého pohoří. - Pomocí next-gen sekvenování napříč genomem (ddRADseq) zrekonstruujeme vznik a evoluční historii horských a nížinných populací A. arenosa. II. Jaké jsou populačně-genetické důsledky kolonizace horských stanovišť? Hypotéza: Horské populace budou vykazovat znaky nedávné redukce genetické diverzity v důsledku rychlé postglaciální kolonizace. - Použijeme ddRADseq data k určení míry vnitro- a mezi-populační genetické variability a identifikujeme stopy minulých demografických procesů v součané genetické struktuře horských populací. III. Je výrazně odlišná morfologie horských rostlin fixována geneticky (adaptace na horské prostředí) nebo se jedná o fenotypickou plasticitu? Hypotéza: Jedinci transplantovaní do odlišného prostředí (horské do nížin a naopak) si do určité míry ponechají původní morfologii, naznačující genetickou fixaci určitých znaků. - Odlišíme vnitřní a vnější faktory ovlivňující morfologii rostlin v recipročním transplantačním experimentu v rakouských Alpách, zahrnující rostliny ze všech tří pohoří. Edukační - semináře na partnerských pracovištích: výměna metodických zkušeností a prezentace výsledků (P. Schönswetter, B. Frajman v Praze; F. Kolář v Innsbrucku) - publikace popularizačního článku o vlivu prostředí a polyploidizace na ekologické a morfologické vlastnosti rostlin (čas. Živa)
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project was being realized in the framework of the MOBILITY Activity that aims primarily on establishing and strenghtening ties with foreign research institutions. The control of particular outputs is not implemented by the evalution committee, but the correctness of allocated finances and the adequacy of their use are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 22, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-MSM-7A-U/02:1
Data delivery date
Jun 8, 2018
Finance
Total approved costs
146 thou. CZK
Public financial support
146 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK