Engineering of methionine and aldehyde metabolizing enzymes linked to human diseases including cancer
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
MSMT-18714/2022-71
Alternative language
Project name in Czech
Proteinové inženýrství enzymů metabolizujících methionin a aldehydy a spojených s lidskými nemocemi včetně rakoviny
Annotation in Czech
Cílem tohoto projektu je provést studii dvou skupin enzymů podílejících se na odstranění methioninu a aldehydů prostřednictvím methionin-γ-lyasy (MGL) a aldehyddehydrogenasy (ALDH). Výzkum MGL je od roku 2019 podporován francouzskou organizací ICIG (Institut du Cancer et d'Immunogénétique) při Nemocnici Paula Brousse ve Villejuif, která považuje za velmi důležité objasnit strukturní základ vazby koenzymu PLP včetně afinity a dynamiky. To by mohlo vést k vytvoření varianty enzymu s potenciální protinádorovou terapeutickou aplikací. Deprivace methioninu je prokazatelně účinná vůči různým typům nádorových buněčných linií a MGL by tak šlo použít synergicky ve spojení s klasickými cytostatiky. Ve shodě s touto prací je velmi důležité objasnit strukturní rozdíly v rozpoznávání aldehydů mezi všemi ALDH rodinami napříč druhy, abychom lépe pochopili dráhy odbourávající aldehydy, jež jsou spojené s různými nemocemi. V PDB databázi stále chybí strukturní informace o lidském a rostlinném enzymu ALDH6, a tím i detailní analýza specificity vůči domnělým substrátům a mechanismu katalýzy. Hlavní cíle lze shrnout následovně: • Krystalová struktura MGL z brevibakterie s vysokým rozlišením • Inženýrství enzymu MGL a hledání nových variant MGL z brevibakterie se zlepšenou vazbou koenzymu PLP metodou místně řízené mutageneze. • Hledání a inženýrství MGL s cílem získat stabilnější enzym a/nebo mající jasnou substrátovou preferenci vůči methioninu. • Produkce a enzymová kinetika lidské a rostlinné ALDH6 • Krystalizace a struktura lidské a rostlinné ALDH6 s vysokým rozlišením. Těchto cílů bude dosaženo pomocí několika přístupů zahrnující výpočetní operace a prohledávání databází (BLAST, Alphafold 2 a výpočty molekulární dynamiky), po kterých bude následovat klonování, rekombinantní exprese a místně řízená mutageneze, purifikace, měření enzymové aktivity, vazebných interakcí a rentgenostrukturní analýzy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 10, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MSM-8J-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
150 thou. CZK
Public financial support
150 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK