AP‐1 reporter constructs for tumor stem cell identification

Provider

Ministry of Education, Youth and Sports

Programme

Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D

Call for proposals

—

Main participants

Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni

Contest type

M2 - International cooperation

Contract ID

--

Project name in Czech

Identifikace nádorových kmenových buněk reportérskými genovými konstrukty závislými na aktivitě transkripčních faktorů AP-1

Annotation in Czech

Příprava unikátního biologického materiálu a jeho validace, provedení vstupních experimentů a zformování mezinárodního týmu, což zakládá perspektivu další vědecké spolupráce na bázi plnohodnotného vědeckého projektu. Jedná se o spojení velmi pokročilé kompetence v základní molekulární biologii, kterou přináší rak. partner, s expertizou v nádorové biologii včetně možného přesahu do klinických aplikací, která je vkladem čs partnera, a v tomto smyslu v sobě projekt nese velký potenciál vzájemného vědeckého synergismu. Jedná se o přípravu reportérského plasmidového konstruktu, který by umožnil monitorování aktivity endogenních transkripčních faktorů AP-1 rodiny v živých buňkách, představujících modely sarkomů měkkých tkání, především fibrosarkomu a liposarkomu. Rak. partner má dlouholetou tradici v charakterizaci AP-1 a obzvláště Jun-onkoproteinů, včetně charakterizace jimi regulovaných genů a izolace jejich promotorových sekvencí, které jsou za jejich aktivaci AP-1 – faktory odpovědné, což usnadní jejich začlenění do rekombinantních reportérských plasmidů, kde tyto sekvence budou předřazeny genu kódujícímu eGFP. Aktivita AP-1 transkripčních faktorů v buněčném jádře se tak bezprostředně projeví zelenou fluorescencí buněk, což umožní jejich identifikaci, vizualizaci, purifikaci, a dlouhodobé sledování v živých nádorových buněčných kulturách, a tyto metodiky jsou plně etablovány na pracovišti čs partnera. Vzhledem k tomu, že zvýšená aktivita Jun a AP-1 komplexů je připisována biologicky a klinicky významným subpopulacím sarkomových buněk, otevře možnost biologické identifikace a monitorování růstu, dělení a smrti těchto buněk v analyzovaných sarkomových modelech cestu k jejich pozdější molekulární analýze, ve smyslu stanovení specifického transkriptomu, proteomu, epigenomu atp., což by otevřelo cestu k identifikaci a charakterizaci nových molekul klinických sarkomů, ať už ve smyslu upřesnění prognózy onemocnění nebo popř. ve smyslu nových terapeutických cílů.

R&D category

ZV - Basic research

OECD FORD - main branch

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

OECD FORD - secondary branch

30101 - Human genetics

OECD FORD - another secondary branch

30204 - Oncology

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

EB - Genetics and molecular biology<br>FD - Oncology and haematology

Provider evaluation

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Project results evaluation

The project was implemented within the framework of the MOBILITY Activity, whose main objective is to establish and deepen contacts with foreign research institutions. Therefore, the partial outputs of the project are not checked by the evaluation committee, but the correctness of the use of the allocated funds and the adequacy of their use are checked.

Realization period - beginning

Jan 1, 2024

Realization period - end

Dec 31, 2025

Project status

U - Finished project

Latest support payment

Feb 13, 2025

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP26-MSM-8J-U

Data delivery date

Jun 30, 2026

Total approved costs

186 thou. CZK

Public financial support

186 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK