AP‐1 reporter constructs for tumor stem cell identification

Provider

Ministry of Education, Youth and Sports

Programme

Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D

Call for proposals

—

Main participants

Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni

Contest type

M2 - International cooperation

Contract ID

--

Project name in Czech

Identifikace nádorových kmenových buněk reportérskými genovými konstrukty závislými na aktivitě transkripčních faktorů AP-1

Annotation in Czech

Příprava unikátního biologického materiálu a jeho validace, provedení vstupních experimentů a zformování mezinárodního týmu, což zakládá perspektivu další vědecké spolupráce na bázi plnohodnotného vědeckého projektu. Jedná se o spojení velmi pokročilé kompetence v základní molekulární biologii, kterou přináší rak. partner, s expertizou v nádorové biologii včetně možného přesahu do klinických aplikací, která je vkladem čs partnera, a v tomto smyslu v sobě projekt nese velký potenciál vzájemného vědeckého synergismu. Jedná se o přípravu reportérského plasmidového konstruktu, který by umožnil monitorování aktivity endogenních transkripčních faktorů AP-1 rodiny v živých buňkách, představujících modely sarkomů měkkých tkání, především fibrosarkomu a liposarkomu. Rak. partner má dlouholetou tradici v charakterizaci AP-1 a obzvláště Jun-onkoproteinů, včetně charakterizace jimi regulovaných genů a izolace jejich promotorových sekvencí, které jsou za jejich aktivaci AP-1 – faktory odpovědné, což usnadní jejich začlenění do rekombinantních reportérských plasmidů, kde tyto sekvence budou předřazeny genu kódujícímu eGFP. Aktivita AP-1 transkripčních faktorů v buněčném jádře se tak bezprostředně projeví zelenou fluorescencí buněk, což umožní jejich identifikaci, vizualizaci, purifikaci, a dlouhodobé sledování v živých nádorových buněčných kulturách, a tyto metodiky jsou plně etablovány na pracovišti čs partnera. Vzhledem k tomu, že zvýšená aktivita Jun a AP-1 komplexů je připisována biologicky a klinicky významným subpopulacím sarkomových buněk, otevře možnost biologické identifikace a monitorování růstu, dělení a smrti těchto buněk v analyzovaných sarkomových modelech cestu k jejich pozdější molekulární analýze, ve smyslu stanovení specifického transkriptomu, proteomu, epigenomu atp., což by otevřelo cestu k identifikaci a charakterizaci nových molekul klinických sarkomů, ať už ve smyslu upřesnění prognózy onemocnění nebo popř. ve smyslu nových terapeutických cílů.

R&D category

ZV - Basic research

OECD FORD - main branch

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

OECD FORD - secondary branch

30101 - Human genetics

OECD FORD - another secondary branch

30204 - Oncology

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

EB - Genetics and molecular biology<br>FD - Oncology and haematology

Realization period - beginning

Jan 1, 2024

Realization period - end

Dec 31, 2025

Project status

Z - Beginning multi-year project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP24-MSM-8J-R

Data delivery date

Jan 29, 2024

Total approved costs

186 thou. CZK

Public financial support

186 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK