Comparison of methods for isolating bacterial extracellular vesicles to study their interaction with host cells
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
-
Alternative language
Project name in Czech
Porovnání metod izolace bakteriálních extracelulárních vezikul pro studium jejich interakce s hostitelskými buňkami
Annotation in Czech
Předpokládáme, že metoda použitá k izolaci bakteriálních extracelulárních vezikul (BEV) z kultivačního média ovlivňuje složení BEV, což může mít následně vliv na jejich interakci s cílovými buňkami. V tomto projektu budeme izolovat E. coli O83 BEV (EcO83-OMV; reprezentující gramnegativní bakterie) a E. faecium CCM7167T (Ef-EV; reprezentující grampozitivní bakterie) pomocí dvou různých metod izolace a purifikace. Budeme charakterizovat jejich biofyzikální a biochemické vlastnosti, složení a vliv na eukaryotické buňky. Cíl 1. Kultivace E. coli O83 a E. faecium CCM7167T. Izolace a purifikace vezikul pomocí vylučovací chromatografie (SEC) a ultracentrifugace na sacharózovém polštáři. Cíl 2. Charakterizace EcO83-OMV a Ef-EV: koncentrace, velikost částic, index polydisperzity (PDI), zeta potenciál (ζ), přítomnost LPS a LTA a proteomická analýza. Cíl 3. Charakterizace mechanismu interakce EcO83-OMV a Ef-EV s eukaryotickými buňkami. Cíl 4. Lokalizace EcO83-OMV a Ef-EV v dendritických buňkách (DC) a v ko-kultuře Caco-2/HT29-MTX, a jejich vliv na fenotyp DC.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
30102 - Immunology
OECD FORD - secondary branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EC - Immunology<br>EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 13, 2025
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MSM-8J-R
Data delivery date
Mar 4, 2025
Finance
Total approved costs
192 thou. CZK
Public financial support
192 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK