Repeated adaptation to ultramafic soils in nickel hyperaccumulating plants
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
-
Alternative language
Project name in Czech
Opakovaná adaptace k půdám kontaminovaným těžkými kovy u nikl akumulujících rostlin
Annotation in Czech
Cíl 1: Odhalení širší variability v rodu Noccaea Na základě floristických dat a odbornosti francouzského týmu bylo vybráno 6 populací Noccaea rostoucích na ultramafických a běžných půdách ve Francii. Jejich fenotypová (Cíl 1) a genomická (Cíl 2) charakterizace doplní česká data ze střední a JV Evropy a poskytne komplexní pohled na adaptaci na ultramafické půdy. V každé populaci bude odebráno 25 jedinců pro analýzu obsahu kovů pomocí ICP-OES a pro stanovení ploidie pomocí průtokové cytometrie. Cíl 2: Identifikace kandidátních genů pro akumulaci Ni a adaptaci na ultramafické půdy Pro odhalení genomických signálů adaptace a hyperakumulace niklu integrujeme genomická, transkriptomická a ionomická data. Český tým provede genomové screeningy a analýzy asociace s prostředím u nově sebraných francouzských populací (Cíl 1). Transkriptomy 8 druhů hyperakumulátorů a 5 genomů druhu N. caerulescens (francouzský tým) budou znovu analyzovány za účelem detekce konvergentních kandidátních genů. Přibližně 80 transkriptomů z reciprokého transplantátu (český tým) odhalí konstitutivně rozdílně exprimované geny. Výsledky budou syntetizovány pomocí síťové analýzy a porovnány se známými geny zapojenými do hyperakumulace, aby byly určeny kandidáty pro funkční testování (Cíl 3). Cíl 3: Funkční charakterizace klíčových kandidátních lokusů Kandidátní geny budou testovány v systémech kvasinek a A. thaliana. Francouzský tým povede funkční testy, zejména zaměřené na membránové transportéry. Český tým bude zkoumat životaschopnost mutantů A. thaliana s narušenými ortology (např. FPN/IREG2, TCP1) pěstovaných na ultramafických půdách.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2026
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP26-MSM-8J-R
Data delivery date
Apr 29, 2026
Finance
Total approved costs
200 thou. CZK
Public financial support
200 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK