Parallel adaptation to alpine environments in wild Arabidopsis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 3 (SGA0201700002)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-20357Y
Alternative language
Project name in Czech
Paralely v adaptaci horských populací dvou druhů Arabidopsis
Annotation in Czech
Adaptace představuje zásadní evoluční proces umožňující druhům vypořádat se změnami prostředí. Opakovaně vzniklé vysokohorské ekotypy dvou druhů rostlinného modelu Arabidopsis, dosud opomíjeny ekologickými i genomickými studiemi, poskytují výjimečnou příležitost charakterizovat klíčové genomické mechanismy paralelní adaptace. Pomocí high-throughput resekvenování genomů 26 populací dvou druhů molekulárně dobře charakterizovaného rodu Arabidopsis kombinovaným s manipulativními kultivačními experimenty projekt cílí na identifikaci celé sady genů konzistentně spojených s divergencí v alpinském prostředí a charakterizaci adaptivní genomické krajiny u přírodních populací Arabidopsis. Díky porovnáním několika nezávisle vzniklých párů ekotypů obývajících obdobné prostředí bude možné identifikovat obecné patrnosti v komplexním procesu selekce a ekotypické adaptace. Identifikace kandidátních lokusů pod selekcí, konzistentně detekovatelné napříč populacemi a druhy, může poskytnout důležité vodítko pro šlechtění užitkových plodin a jejich toleranci k environmentálním výzvám.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 10, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GJ-R/02:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
5,979 thou. CZK
Public financial support
5,979 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK