Genome duplication as an imperfect barrier in speciation? Evolutionary drivers and consequences of inter-ploidy introgression in natural populations
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-22783S
Alternative language
Project name in Czech
Genomová duplikace jako nedokonalá speciační bariéra? Evoluční mechanismy a důsledky mezi-ploidní introgrese v přírodních populacích
Annotation in Czech
Genomová duplikace (polyploidizace) je hlavní silou sympatrické speciace, především u rostlin včetně mnoha plodin. Oproti běžnému předpokladu, že polyploidizace vytváří okamžitou bariéru v genovém toku mezi cytotypy, výsledky naší populačně genomické studie u Arabidopsis ukázaly, že meziploidní genový tok může být v přírodě velmi silný. Mechanizmy a evoluční důsledky tohoto jevu však zůstávají neznámé. Cílem projektu je odhalit obecné mechanismy meziploidní bariéry u 5 rostlinných druhů a testovat hypotézu, že selekce může podporovat meziploidní introgresi. Pomocí experimentálního křížení a transkriptomiky odhalíme podstatu meziploidní bariéry a příčiny variability v její síle. Populačně-genomickými metodami pak kvantifikujeme vliv selekce na introgresní varianty a otestujeme hypotézu adaptivní introgrese v přírodních populacích Arabidopsis. Výsledky projektu mají za cíl posunout naše vnímání polyploidní evoluce směrem k introgresním scénářům speciace a poskytnout informace o potenciálních rizicích introgrese při šlechtění polyploidních plodin.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 12, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
9,787 thou. CZK
Public financial support
9,787 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK