Pathways and consequences of polyploidy and chromosomal variation in plant evolution - three cases from the model family Brassicaceae
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-10809S
Alternative language
Project name in Czech
Role polyploidie a chromozomálních změn v evoluci rostlin - tři příklady z modelové čeledi Brassicaceae
Annotation in Czech
Projekt se zabývá příčinami a důsledky polyploidizace (duplikace celého genomu) na příkladu tří polyploidních komplexů z čeledi Brassicaceae. Věnuje se vlivu kryptické variability diploidních a nezávisle vzniklých polyploidních linií, ekologickým a morfologickým důsledkům polyploidizace a vlivu selekce na genomy diploidních a polyploidních linií. V systému Cardamine pratensis projekt také řeší otázku evolučního potenciálu stabilních změn v počtu jednotlivých chromozómů (dysploidie). Projekt využívá nové genomické techniky (RADseq, target enrichment, genome resequencing), srovnávací malování chromozómů (CCP), ekologické experimenty i bioklimatické modelování. Klíčovou výhodou je detailní znalost všech tří rostlinných systémů členy týmu, zahrnující podrobné údaje o evoluční historii, zkušenost s navrhovanými metodami v rámci studovaných systémů a sebraný materiál pro analýzy DNA. Studované taxony jsou blízce příbuzné modelovému druhu Arabidopsis thaliana, což usnadňuje použití a interpretaci genomických metodik a zároveň zajišťuje širokou odezvu publikovaných výsledků.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project contributed to understanding of ecological and evolutionary aspects of polyploidisation in plants. 11 publications is dedicated to the project, some of them ranking in Q1. The research is dedicated to several projects provided by GACR or other (international) agencies due to the broad international collaboration and the research period extending the time period of the project.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 11, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 30, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/06:1
Data delivery date
Jun 30, 2021
Finance
Total approved costs
15,013 thou. CZK
Public financial support
14,980 thou. CZK
Other public sources
33 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK