Even plants can lose their sex drive: Exploring the links between hybridization, chromosomal reorganization and evolution of apomixis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202400001
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
24-11371S
Alternative language
Project name in Czech
I rostliny mohou ztratit sexuální touhu: Prozkoumání souvislostí mezi hybridizací, chromozomální reorganizací a evolucí apomixie
Annotation in Czech
Rod Boechera (Brassicaceae) zahrnuje diploidní sexuálně se rozmnožující druhy, stejně jako allodiploidní a allotriploidní apomikty. U apomiktických rostlin byly popsány heterochromatinové chromozomy spojené s apomixí. Díky svému malému genomu, blízké evoluční příbuznosti s huseníčkem a přirozeně se vyskytujícím diploidním sexuálním a diploidním apomiktickým liniím představuje rod Boechera jedinečný modelový systém pro studium genomických změn spojených s apomixií. Pokročilé sekvenování dlouhých čtení společně s novými algoritmy sestavování genomových sekvencí umožňují telomere-to-telomere sekvenování, včetně čtení komplexních (peri)centromerických oblastí. Navrhujeme analyzovat Boechera genomy s použitím sekvenování dlouhých čtení, doplněné o cytogenomické a epigenetické analýzy, s cílem pochopení vztahů mezi hybridizací, reorganizací chromozomů a evolucí apomixie. Tento projekt prohloubí naše poznání o genomické struktuře a evoluční dynamice apomiktických genomů v rodu Boechera. To položí základ pro pochopení obecných molekulárních mechanismů vedoucích k expresi apomixie.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
10611 - Plant sciences, botany
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 27, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
11,628 thou. CZK
Public financial support
11,628 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK