The role of hybridization and apomixis in evolution of the tribe Boechereae
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 1 (SMSM2016LTA01)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-16988/2017-1
Alternative language
Project name in Czech
Role hybridizace a apomixie v evoluci tribu Boechereae
Annotation in Czech
Cílem projektu je prozkoumat strukturu genomu a způsob vzniku 25 až 30 druhů a populací rodu Boechera a tribu Boechereae (Brassicaceae) endemicky se vyskytujících v severní Americe. Navrhujeme kombinovat několik jedinečných metodických přístupů s možností studovat řadu biologických fenoménů, a to např. homoploidní hybridizaci, vztah mezi hybridizací, polyploidizací a apomixií, roli chromosomových přestaveb ve speciaci, vznik aberantních chromosomů u aneuploidů aj. Rod Boechera (> 110 druhů) zahrnuje převážně diploidní a triploidní druhy, které se rozmnožují sexuálně anebo apomikticky. Častá hybridizace mezi diploidními sexuály vede ke vzniku diploidních a aneuploidních apomiktů, následné křížení mezi diploidními sexuály a apomikty zapříčiňuje vznik apomiktických triploidů. Je zřejmé, že výsledkem opakovaných hybridizací je vysoký počet morfologicky intermediárních apomiktických typů, jejichž vznik je obtížné vysledovat a taxonomicky zařadit. Vzhledem k apomixii na diploidní úrovni a příbuznosti s modelovým druhem huseníčkem rolním (Arabidopsis thaliana), představuje rod Boechera unikátní modelový systém studia apomiktického způsobu reprodukce rostlin, s výrazným aplikačním potenciálem.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
GE - Plant cultivation
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Results include a high number of comparative cytogenomic maps for Boechera and Boechereae species. These results allowed for reconstruction of the origin and evolution of Boechereae genomes, and deeper understanding how apomictic reproduction is associated with chromosome rearrangements in Boechera. Embryological analyses showed that apomixis originated in the Boechereae repeatedly. The identification of hybrid apomictic genomes using genome-specific microsatellite markers was further optimized and a series of inter-species hybrids was created to further analyze the association between apomixis and chromosome rearrangements. Three scientific papers resulting from the project were published.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 24, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-MSM-LT-U/01:2
Data delivery date
Jul 1, 2021
Finance
Total approved costs
3,666 thou. CZK
Public financial support
3,666 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK