Successful without sex: (R)evolution of genomes in the apomictic tribe Boechereae
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
SMSM2026LU001
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-6303/2026-13
Alternative language
Project name in Czech
Úspěšné bez sexu: (R)evoluce genomů v apomiktickém tribu Boechereae
Annotation in Czech
Projekt si klade za cíl komplexně objasnit vznik, diverzitu a stabilizaci apomixie v rodu Boechera prostřednictvím integrace genomových, transkriptomových, epigenetických a cytogenetických dat. Navazuje na předběžné poznatky o struktuře diploidních genomů a rozšiřuje analýzu na širší spektrum diploidních apomiktů, včetně mezi- a vnitrodruhových hybridů a fakultativních linií, a dále na triploidní apomikty s komplexní subgenomovou strukturou. Cíl 1 je zaměřen na charakterizaci genomové architektury a evolučního původu diploidní apomixie pomocí srovnávací analýzy reprezentativních linií a identifikace chromozomů asociovaných s apomixií. Cíl 2 se soustředí na triploidní apomikty, jejich hybridní původ, subgenomovou organizaci a mechanismy stabilizace v polyploidním kontextu. Cíl 3 využívá srovnávací genomiku dalších rodů tribu Boechereae a Halimolobeae k identifikaci evolučních trajektorií vedoucích ke vzniku apomixie. Cíl 4 se zaměřuje na transkriptomovou analýzu s cílem odhalit regulační dráhy a kandidátní geny spojené s přechodem od sexuality k apomixii. Cíl 5 zkoumá epigenetické mechanismy (DNA methylace, histonové modifikace) a jejich roli v potlačení rekombinace a stabilizaci genomu. Cíl 6 analyzuje prostorovou organizaci genomu a meiotické chování chromozomů s cílem objasnit mechanismy stabilizace hybridních genomů. Projekt přinese referenční genomy, identifikaci klíčových struktur a regulačních drah spojených s apomixií a zásadní poznatky o evoluci reprodukčních systémů s potenciálem využití v rostlinné biologii a šlechtění.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2026
Realization period - end
Dec 31, 2029
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP26-MSM-LU-R
Data delivery date
Apr 24, 2026
Finance
Total approved costs
9,832 thou. CZK
Public financial support
9,832 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK