Population genomic evidence of inter-ploidy introgression and its adaptive significance in natural populations
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
SGA0202300006
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-07275I
Alternative language
Project name in Czech
Populačně genomické důkazy interploidní introgrese a její adaptivní význam v přirozených populacích
Annotation in Czech
Často se předpokládá, že polyploidie způsobuje okamžitou reprodukční izolaci v důsledku sterility a neživotaschopnosti interploidních potomků. Nedávný výzkum prokázal, že v přirozených populacích diploidů a tetraploidů dochází k rozsáhlé introgresi genomu. Přesto zůstává nejasné, jak běžná taková interploidní introgrese je a do jaké míry přispívá k adaptaci. V této studii budu hodnotit populačně genomické důkazy meziploidního toku genů a jeho adaptační význam v osmi rostlinných systémech, v nichž se ploidie v přirozených populacích liší. Budu identifikovat jak lokální introgresi, tak kvantifikovat tok genů v celém genomu. Poté prozkoumám roli adaptace a související selekce a poskytnu obecné shrnutí napříč systémy. Tento projekt rozšíří mé předchozí zkušenosti v oblasti populační genetiky a genomiky díky stáži ve skupině F. Koláře, který je předním odborníkem v oblasti výzkumu polyploidie přirozeně rostoucích rostlin. Znalosti získané v rámci navrhovaného projektu by mohly nově definovat roli polyploidie pro reprodukční izolaci a vzhledem k vysokému počtu zkoumaných polyploidních rost
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
10611 - Plant sciences, botany
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GN-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
6,254 thou. CZK
Public financial support
6,254 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK