Comparative parasite hybridisation genomics controlling for host divergence
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-19629S
Alternative language
Project name in Czech
Srovnávací genomika hybridizace parazitů s ohledem na míru divergence hostitelů
Annotation in Czech
Hybridní zóny parazitů jsou stále nedostatečně studovány navzdory tomu, že se jedná o unikátní přírodní laboratoře vhodné pro výzkum mechanismů vzniku adaptací a hostitelské specificity. Systém, ve kterém se potkávají populace hostitele s různou mírou divergence, umožňuje studovat vliv odlišnosti hostitele na míru introgrese diferencovaných genomů jeho parazitů. V projektu navrhujeme studovat tuto introgresi u betaherpesvirů a hlístic rodu Syphacia u hlodavců Mastomys natalensis. V Tanzánii se potkávají a hybridizují tři vnitrodruhové taxony tohoto hlodavce. Předpokládáme, že pro hostitele i parazita se budou bariéry introgrese zvyšovat s rostoucí divergencí hostitelských taxonů. Kontaktní zóny mezi příbuznějšími hostiteli budou mít širší kliny v alelických frekvencích než u taxonů evolučně vzdálenějších a tato patrnost by měla být ještě výraznější pro parazity, vzhledem k jejich kratší generační době. Srovnání vzoru genomické introgrese u hostitele i parazita nám umožní rovněž identifikovat klíčové geny pro interakce mezi hostiteli a jejich parazity (například geny tzv."emergence").
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Mar 25, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
9,472 thou. CZK
Public financial support
9,117 thou. CZK
Other public sources
355 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK