Hybrid zones: natural laboratories for the study of pathogen emergence
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-20049S
Alternative language
Project name in Czech
Hybridní zóny: přírodní laboratoře pro studium patogenů vzniku
Annotation in Czech
Rekombinace a adaptace k novému hostiteli jsou klíčovými faktory nástupu infekce. Při studiu interakcí mezi hostitelem a parasite v hybridní zóně (HZ) myši domácí jsme zjistili, že parazité s úzkou vazbou na hostitele mají genetickou skladbu podobnou hostitelské HZ a produkují hybridy v centru zóny. Dále jsme prokázali, že u DNA viru ty geny, které narušují imunitní systém myší, se šíří přednostně přes zónu. Prvním cílem je pomocí komparativně-genomického přístupu testovat obecnost této výhodné introgrese studiem dvou zcela odlišných parazitů: houby Pneumocystis murina a hlísta Syphacia obvelata. Druhým cílem je testování adaptivní výhody těchto genů pomocí „common garden“ experimentů. Spojení nejnovějších postupů sekvencování, analytických a výpočetních metod tento projekt odhalí procesy vedoucí k rekombinaci a evoluci parasitů, které jsou fundamentální pro pochopení nově vznikajících nemocí.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
40301 - Veterinary science
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The merit of presented project outputs is lowered by the multiple dedications to CSF project solved at the PI's institute. The most important output should be the paper in preparation by Petruzela et al., „Comparative genomics of parasites in the European house mouse hybrid zone“.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 11, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
8,881 thou. CZK
Public financial support
8,881 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK