Quantifying viral gene capture, and the host’s response, during passage across a species barrier: Murine cytomegalovirus in a house mouse hybrid zone.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-35009S
Alternative language
Project name in Czech
Rekombinační schopnost virů k prolomení druhové bariéry a obranných mechanismů hostitele: myší cytomegalovirus v hybridní zóně myší domácích.
Annotation in Czech
Nejrychlejším způsobem tvorby genetické proměnlivosti v závodě zbrojení mezi hostitelem a parasitem je vznik nových sekvenčních a genových kombinací prostřednictvím procesu rekombinace. V hybridní zóně, kde dochází k rekombinaci mezi odlišnými taxony, může být produkce nových (re)kombinací ještě účinnější; navíc, díky předchozí divergenci je jejich detekce jednodušší. Hybridní zóna myši domácí (HMHZ) a myší cytomegalovirus (MCMV) představují ideální model ke studiu dynamiky výše uvedených procesů a k testování předpovědí nově popsaného rekombinačního modelu Červené královny. HMHZ je nejlépe prozkoumaným sekundárním kontaktem dvou poddruhů a MCMV je laboratorním modelem lidského ekvivalentu s dobře popsanou ekologií a molekulární biologií. Malý genom (~170 genů) umožňuje jeho celogenomové studium a sekvenování (~ 230 kb). Studium HMHZ/MCMV systému pomocí „Next Generation“ metod nám umožní kvantifikovat schopnost viru k rekombinačnímu zachycení variant genů, které usnadňují jeho přechod přes HMHZ, a naopak schopnost hostitele přijmout alternativní obranné prostředky proti šíření MCMV.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EH - Ecology - communities
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The research was conducted in accordance with plans of three years research project. The first two objectives were fulfilled completely; the last objective is delayed. These delays did not affect the overall success of the project. Two papers were already published in impacted journals. One PhD student was trained during the project.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Apr 23, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 17, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
6,095 thou. CZK
Public financial support
6,095 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK