All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Quantifying viral gene capture, and the host’s response, during passage across a species barrier: Murine cytomegalovirus in a house mouse hybrid zone.

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 18 (SGA0201400001)

  • Main participants

    Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    14-35009S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Rekombinační schopnost virů k prolomení druhové bariéry a obranných mechanismů hostitele: myší cytomegalovirus v hybridní zóně myší domácích.

  • Annotation in Czech

    Nejrychlejším způsobem tvorby genetické proměnlivosti v závodě zbrojení mezi hostitelem a parasitem je vznik nových sekvenčních a genových kombinací prostřednictvím procesu rekombinace. V hybridní zóně, kde dochází k rekombinaci mezi odlišnými taxony, může být produkce nových (re)kombinací ještě účinnější; navíc, díky předchozí divergenci je jejich detekce jednodušší. Hybridní zóna myši domácí (HMHZ) a myší cytomegalovirus (MCMV) představují ideální model ke studiu dynamiky výše uvedených procesů a k testování předpovědí nově popsaného rekombinačního modelu Červené královny. HMHZ je nejlépe prozkoumaným sekundárním kontaktem dvou poddruhů a MCMV je laboratorním modelem lidského ekvivalentu s dobře popsanou ekologií a molekulární biologií. Malý genom (~170 genů) umožňuje jeho celogenomové studium a sekvenování (~ 230 kb). Studium HMHZ/MCMV systému pomocí „Next Generation“ metod nám umožní kvantifikovat schopnost viru k rekombinačnímu zachycení variant genů, které usnadňují jeho přechod přes HMHZ, a naopak schopnost hostitele přijmout alternativní obranné prostředky proti šíření MCMV.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EH - Ecology - communities

  • CEP - secondary branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - another secondary branch

    EE - Microbiology, virology

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    The research was conducted in accordance with plans of three years research project. The first two objectives were fulfilled completely; the last objective is delayed. These delays did not affect the overall success of the project. Two papers were already published in impacted journals. One PhD student was trained during the project.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2014

  • Realization period - end

    Apr 23, 2018

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Mar 17, 2016

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP19-GA0-GA-U/01:1

  • Data delivery date

    Jun 12, 2019

Finance

  • Total approved costs

    6,095 thou. CZK

  • Public financial support

    6,095 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK