Viromics of the European house mouse hybrid zone: a model to understand how viruses cross host species barriers
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-32394S
Alternative language
Project name in Czech
Viromika myši domácí na hybridní zóně v Evropě: model pro studium šíření virů a překonávání druhových bariér
Annotation in Czech
Mnoho emergentních onemocnění je způsobeno viry, které jsou schopné překonat druhové bariéry. Sekvenování "High throughput sequencing" (HTS) vedlo k bezprecedentním objevům týkajících se rozmanitosti virů, a to i v dobře studovaných modelech, jako je myš domácí. Naším cílem je využít známý kontext evropské hybridní zóny myši domácí (HZMD) ke zkoumání faktorů, které se podílejí na šíření virů se zvláštním zaměřením na jejich rekombinaci a genetickou přestavbu. Díky cílenému obohacení genomu metodou “capture-based” a HTS provedeme rozsáhlý screening virů ve "staré" a "recentní" části HZMD. Následně se zaměříme na faktory prostředí a hostitelů s ohledem na geografickou distribuci virové komunity napříč HZMD. Rovněž budeme identifikovat události rekombinace/genetické přestavby, porovnáme vzory a procesy pro různé genomové architektury virů a jejich přenos v komunitě hlodavců.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
30303 - Infectious Diseases
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Mar 6, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
10,195 thou. CZK
Public financial support
10,195 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK