Genetic structure of chamois populations in Central Europe
Project goals
The Tatra chamois (Rupicapra rupicapra tatrica) inhabits the High Tatra Mts. (autochthonous population) and the Low Tatra Mts. (introduced population) in Slovakia. It is a distinguished evolutionary significant unit, and is listed as critically endangered in the IUCN Red List of Threatened Species. In the 20th century, Alpine chamois (R. r. rupicapra) were introduced to the Velká Fatra and to the Slovenský ráj. As these mountain ranges are geographically close, hybridisation with Alpine chamois, resulting from occasional migrations, might have occurred. The aim of this study is detailed analysis of the population genetic structure of chamois populations in Slovakia by using non-invasive DNA analyses (mtDNA, microsatellites, MHC) from faeces. We will focus on potential introgression of Alpine chamois to the Tatra chamois genome, gene flow pattern, MHC variability, and effect of isolation on differentiation and kinship structure. The results will be used in conservation management.
Keywords
population structurepopulation geneticsRupicapramicrosatellitesmtDNAMHChybridizationconservation genetics
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 6 (SAV02006-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA600930609
Alternative language
Project name in Czech
Genetická struktura populací kamzíka horského ve střední Evropě
Annotation in Czech
Kamzík horský tatranský (Rupicapra rupicapra tatrica) obývá na Slovensku oblast Vysokých Tater (autochtonní populace) a Nízkých Tater (introdukovaná populace). Je považován za samostatnou evoluční jednotku a je zařazen do Červeného seznamu IUCN jako kriticky ohrožený. Ve druhé polovině 20. století byl do Velké Fatry a Slovenského ráje introdukován k. h. alpský (R. r. rupicapra). Občasné migrace kamzíků, pozorované mimo území trvalého výskytu tatranských a alpských populací, mohly nicméně vést k hybridizaci. Cílem projektu je detailní analýza populačně-genetické struktury populací kamzíků na Slovensku použitím neinvazivní analýzy DNA z trusu (mtDNA, mikrosatelity, MHC). Pozornost bude zaměřena na potenciální introgresi genomu k. h. alpského do genomu k.h. tatranského, tok genů, MHC variabilitu a efekt izolace populací na jejich diferenciaci a příbuzenskou strukturu. Výsledky budou široce využity v ochranářském managementu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10613 - Zoology
10614 - Behavioral sciences biology
10615 - Ornithology
10616 - Entomology
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Based on microsatellite, MHC and mitochondrial DNA analyses was reveal low genetic variability in populations of Tatra and Alpine chamois in Slovakia. In the Low Tatra population was detect hybridisation with Alpine subspecies.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-AV0-IA-U/01:1
Data delivery date
Jun 8, 2010
Finance
Total approved costs
4,281 thou. CZK
Public financial support
4,281 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
4 281 CZK thou.
Public support
4 281 CZK thou.
100%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
EG - Zoology
Solution period
01. 01. 2006 - 31. 12. 2009