Mechanisms and impact of polyploidisation in evolution of animals – lessons from the fish family Botiidae
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-37277S
Alternative language
Project name in Czech
Mechanismy a role polyploidizace v evoluci živočichů – příklad ryb čeledi Botiidae
Annotation in Czech
Tento projekt je zaměřen na mechanismus, jakým proces polyploidizace může působit jako hlavní hnací síla evoluce společně s vikariancí a adaptivní speciací. V projektu uvádíme vhodný model - sladkovodní ryby čeledi Botiidae, které se vyskytují v geologicky aktivní oblasti Asie a zahrnují dva diploidní a šest tetraploidních rodů. Chtěli bychom 1) rozřešit původ polyploidie (auto- vs. alopolyploidizace) pomocí metod cytogenetiky (barvení celých chromosomů, analýza meiotického dělení, malovací sondy) a molekulární genetiky (analýzou alel v genových stromech u tetraploidních druhů); 2) prověřit monofylii polyploidních taxonů (jedna polyploidizace nebo více nezávislých) fylogenetickou analýzou vybraných jaderných a mitochondriálních genů; 3) prověřit případný tok genů mezi rody různé ploidní úrovně srovnáním mitochondriální a jaderné fylogenie; 4) spočítat stáří významných genealogických událostí a porovnat jej se známou geologickou historií oblasti. Výsledky by měly pomoci při nástinu obecných závěrů o mechanismu a vlivu polyploidizace na evoluci živočichů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EG - Zoology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project solve the role of polyploidization in the evolution of vertebrates.The tetraploid family of Botiidae fish species, which is probably result of an allopolyploidization event closely related groups of Botiidae. The polyploidization after hybridization occurs repeatedly. Polyploidization events of allopolyploidization started 100-10 million years ago; autopolyploidizations are younger.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
9,893 thou. CZK
Public financial support
9,893 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK