Post-polyploid genome evolution in Microlepidieae (Brassicaceae)
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
SGA0202000002
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-03419Y
Alternative language
Project name in Czech
Post-polyploidní evoluce genomů v tribu Microlepidieae (Brassicaceae)
Annotation in Czech
Opakující se cykly polyploidizace a post-polyploidní diploidizace (PPD) ovlivnily evoluci genomů, speciaci a kladogenezi rostlin. Nicméně jen málo je známo o interakcích a funkční divergenci subgenomů během PPD. Tribus Microlepidieae (MICR) z čeledi brukvovitých vznikl mezitribovou hybridizací a vyznačuje se kladově specifickou PPD a diversifikacemi. Za účelem získání většího vhledu do evoluce subgenomů v tribu MICR a evoluce jeho rodičovských genomů, navrhujeme získat vysoce kvalitní genomová a transkriptomová sestavení čtyř tetraploidních druhů a čtyř diploidních druhů reprezentující obě rodičovské linie. Naším cílem je (i) stanovit genomovou strukturu těchto druhů, (ii) specifikovat vntro- a mezi-subgenomové přestavby, (iii) popsat vzorce genové frakcionace a subgenomové dominance, (iv) vyjasnit dynamiku transponovatelných elementů a strukturní genomové variability, a (v) využít fylogenomické přístupy k datování druhových divergencí a polyploidizace(í). Naše poznatky přispějí k lepšímu pochopení post-polyploidní genomové diploidizace u rostlin.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 12, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GJ-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
6,567 thou. CZK
Public financial support
6,567 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK