Phylogenetic interrelations of the fish family Cobitidae: a multi-disciplinary approach including molecular gnetics, morphology and cytogenetics
Project goals
The Cobitidae are one of the major freshwater fish families in Europe and Asia. They are considered as monophyletic, but the relations between genera is unsolved. Especially the way, time and repetitions of a colonisation of Europe and a comparison of the extent of radiation in Europe versus Asia is wanted to understand biogeography and speed of evolution in this group. Since polyploidy was reported frequently within the family on various levels (individual, species, genus), a karyotype analyses will flank the project to estimate the impact of polyploidisation as an evolutionary force in radiation of higher animal taxa. A morphological investigation of the investigated taxa will allow conclusions on the impact of species-specific adaptation to the highdiversity of this fish family. A compilation of the molecular, cytogenetic and morphologic results will lead to a taxonomic revision of this difficult group and estimate the impact of genetics versus ecology in the evolution of fishes.
Keywords
molecular geneticsphylogenycytogeneticsploidy levelsCobitidaeBotiinaeloachestaxonomy
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 5 (SAV02005-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA600450508
Alternative language
Project name in Czech
Fylogenetické vztahy sekavcovitých ryb (Cobitidae): multidisciplinární přístup využívající molekulární genetiky, morfologie a cytogenetiky
Annotation in Czech
Čeleď Cobitidae je jedním z nejdůležitějších prvků sladkovodních ryb Evropy a Asie. Uvažuje se o jejím monofyletickém původu nicméně vzájemné vztahy mezi dosud stanovenými rody jsou zcela nevyjasněné a neznámé. Porozumět způsobu, časové dimenzi a opakování kolonizace Evropy stejně jako srovnání rozsahu radiací v Evropě a Asii vyžaduje porozumět biogeografii a rychlosti evoluce této skupiny. Protože polyploidizace byla vícekrát objevena uvnitř této skupiny na různých úrovních (jedinec, druh, rod), cytogenetické analýzy odhadnou rozsah tohoto jevu a vliv polyploidizace jako evolučního mechanismu v radiaci skupiny. K objasnění fylogenetických vztahů mezi nimi budou porovnány sekvence dvou úseků mtDNA - genu pro 12SrDNA a pro cytochrom b u zástupců dosud popsaných rodů a podrodů čeledi. Morfologická analýza umožní přispět k taxonomické revizi a posoudit paralelní adaptace v evoluci. Kombinace těchto přístupů (molekulárního, morfologického, cytogenetického) umožní porozumět jejich evoluci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EG - Zoology
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10613 - Zoology
10614 - Behavioral sciences biology
10615 - Ornithology
10616 - Entomology
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
This project clarified the relations of genera of fishes of the family Cobitidae using molecular genetics and morphology and the phylogenetic position of the family within the order Cypriniformes. The phylogenetic structure within big genera is resolved.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 1, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
1,545 thou. CZK
Public financial support
1,545 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
1 545 CZK thou.
Public support
1 545 CZK thou.
100%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2005 - 01. 12. 2007