Phylogenetic relationships of loach fishes (Teleostei: Cobitoidea) as inferred by molecular markers and the role of polyploidisation in evolution
Project goals
Fishes of the families Cobitidae and Balitoridae form one of the most diverse groups of freshwater fishes in Eurasia and have been used as examples in biogeography. Additionally, polyploidisation events occurred índependently on the levels of species, genera and subfamilies, making loaches an ideál model to study the role of polyploidisation in evolution and radiation. However, basing on characters of morphology there is no agreement about number and outline of families, genera and species groups or therelations among them, which hampers the efficient use of this amazing animal model. In the present project, molecular genetic data will be ušed to analyse the phylogenetic relationships among loach fishes. Basing on the results, the families, genera andspecies groups can be inferred. In the second step, cytogenetic data will be used to interpret the impact of polyploidisation and other cytogenetic changes on the definition and evolution of phylogenetic lineages within the groups. This combination
Keywords
molecular phylogeneticscytogeneticstaxonomyphylogeographypolyploidizationevolutionary history
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
206/05/2556
Alternative language
Project name in Czech
Rekonstrukce fylogenetických vztahů sekavcovitých a mřenkovitých ryb (Teleostei: Cobitoidea) na základě molekulárních znaků a role polyploidizace v evoluční
Annotation in Czech
Čeledi sekavcovitých (Cobitidae) a mřenkovitých (Balitoridae) představují jedny z nejrozmanitějších skupin eurasijských sladkovodních druhů ryb. Někteří zástupci byli použiti jako model pro biogeografii. Krom toho je zde známo několik případů polyploidizace, a to na úrovni druhů, rodů i celých podčeledí. Počet čeledí, rodů a druhových skupin, jakož i hranice a vztahy mezi nimi, není možně zodpovědět na základě morfologických znaků, které byly dosud jediným kritériem pro taxonomickou organizaci této jedinečné skupiny sladkovodních ryb a právě výše zmíněné nejasnosti v taxonomickém třídění brání jejímu plnému využití jakožto evolučního modelu. V předkládaném projektu budou k vyjasnění fylogenetických vztahů v rámci skupiny Cobitoidea a pro identifikaci jednotlivých čeledí, rodů i druhů využity molekulárně genetické znaky. Data získaná cytogenetickými metodami budou použita pro interpretaci vlivu polyploidizace a jiných změn v karyotypu na evoluci Unií v rámci této skupiny. Kombinace
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EG - Zoology
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10613 - Zoology
10614 - Behavioral sciences biology
10615 - Ornithology
10616 - Entomology
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The present project intended in the first line to study the interrelations among fishes of the superfamily Cobitoidea. In order to realise this aim, the number of families and outline was estimated using modern methods of molecular genetics. With these m
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
4,734 thou. CZK
Public financial support
3,729 thou. CZK
Other public sources
1,507 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
4 734 CZK thou.
Public support
3 729 CZK thou.
78%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2005 - 31. 12. 2007