Genomic approaches towards the improvement of pod shatter resistance in Brassica napus
Project goals
The aim of the project is the exchange of experiences in the field of breeding and research of rape genome / transcriptome, transfer of molecular marker technologies and identification of genes associated with target features, exchange of genetic resources of rape. Project objectives: • exchange of experience/staff in the field of rape genomics and the use of genomic approach in rape breeding • trechnology transfer - associative transcriptomics technology and identification of functional candidate genes based on RNA-seq and WGCNA analysis from a Czech partner (CZ-PRC) • technology transfer from a Chinese partner in the field of rape breeding, MAS technology and genome editing (PRC-CZ) • analysis of Czech genetic resources of rapeseed, evaluation of allelic variability of genes associated with pod shatter resistance • transfer of gene pyramiding technology using MAS approach and use of CRISPR / Cas9 for genome editing and improvement of resistance level • joint development of a strategy for the development of rapeseed varieties suitable for mechanized harvesting and demonstrating a high resistance to pod shatter.
Keywords
Rapeseed breedingBrassica napusmolecular markersgenomicsQTL mappinggene identificationpod shatter resistance
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Fakulta zemědělská a technologická
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
MSMT-10159/2019-2
Alternative language
Project name in Czech
Genomické přístupy ve šlechtění řepky: tvorba genotypů s vyšší odolností proti pukání šešulí
Annotation in Czech
Cílem projektu je výměna zkušeností v oblasti šlechtitelského výzkumu a výzkumu genomu/transkriptomu řepky, přenos technologií molekulárního markerování a identifikace genů spojených s cílovými znaky, výměna genetických zdrojů řepky. Cíle projektu: • vzájemná výměna zkušeností/pracovníků v oblasti genomiky řepky a využití genomického přístupu ve šlechtění řepky • přenos technologie asociativní transkriptomiky a identifikace funkčních kandidátních genů na základě RNA-seq a WGCNA (weighted gene co-expression network analysis) analýzy od českého partnera (CZ-PRC) • přenos technologií od čínského partnera z oblasti hodnocení odolnosti proti pukání šešulí, technologie MAS a editace genomu (PRC-CZ) • analýza českých genetických zdrojů řepky, hodnocení alelické variability genů spojených se znakem odolnosti proti pukání šešulí • přenos technologie pyramidování genů pomocí přístupu MAS a využití technologie CRISPR/Cas9 pro editaci genomu a zlepšení úrovně odolnosti • společná tvorba strategie pro vývoj odrůd řepky vhodných pro mechanizovanou sklizeň a manifestujících vysokou odolnost proti pukání šešulí.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
EB - Genetics and molecular biology
EI - Biotechnology and bionics
GC - Plant growing, crop rotation
GE - Plant cultivation
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project was being realized in the framework of the MOBILITY Activity that aims primarily on establishing and strenghtening ties with foreign research institutions. The control of particular outputs is not implemented by the evalution committee, but the correctness of allocated finances and the adequacy of their use are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 29, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-MSM-8J-U
Data delivery date
Jun 30, 2022
Finance
Total approved costs
296 thou. CZK
Public financial support
296 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
296 CZK thou.
Public support
296 CZK thou.
0%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
OECD FORD
GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming
Solution period
01. 01. 2019 - 31. 12. 2021