Vývoj metod pro studium struktury farmakologicky aktivních enzymů
Project goals
This project will establish the first structural biology consortium in the Danube region, creating a regional research cluster between Serbia, Slovakia and the Czech Republic. Multilateral cooperation will foster development of structural biology methods for study of pharmacologically active enzymes important for treatment of human cancers and pathogenic bacterial infections. Specifically we will merge expertise and resources in structural bioinformatics (Serbia), protein crystallization (Slovakia) and X-ray diffraction (Czech Republic) to accomplish our scientific goals. Pharmacologically active enzymes affect the efficacy of clinical drugs by activation/inhibition of drug compounds, improving drug stability or delivery, or exposing new targets of action. By elucidating the molecular basis of these phenomena, this research will impact efforts to overcome drug resistance in human cancers and pathogenic infections. X-ray crystallography provides details of interatomic interactions necessary for understanding protein function and rational design of improved drugs. Project leaders in each partner country have solved numerous crystal structures of proteins using X-ray crystallography. Scientific activities described in this proposal are funded within the scope of national projects ongoing at each partner country. We will study three classes of pharmacologically active enzymes at the atomic level using X-ray crystallography and computational methods: 1) endolysins (Slovakia), 2) carbonic anhydrases (Czech Republic) and 3) aldoketoreductases (Serbia).
Keywords
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Programme for Funding Multilateral Scientific and Technological Cooperation Projects in the Danube Region
Call for proposals
Program pro financování projektů mnohostranné vědeckotechnické spolupráce v Podunajském regionu (SMSM20168X001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-3375/2017-1
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj metod pro studium struktury farmakologicky aktivních enzymů
Annotation in Czech
Tento projekt položí základ prvnímu strukturně biologickému konsorcium v Podunajském regionu tím, že podpoří regionální výzkumnou spolupráci mezi Srbskem, Slovenskem a Českou republikou. Mnohostranná spolupráce podpoří rozvoj metod strukturní biologie pro studium farmakologicky účinných enzymů, které jsou důležité pro léčbu lidských nádorů či patogenních bakteriálních infekcí. K dosažení vědeckých cílů projektu budou propojeny odborné znalosti a zdroje strukturní bioinformatiky (srbské pracoviště), proteinové krystalizace (slovenské pracoviště) a rentgenové difrakce (české pracoviště). Farmakologicky účinné enzymy ovlivňují účinnost klinických léčiv aktivací nebo inhibicí složek léčiv, zlepšují stabilitu léčiv a některé též představují nové léčebné cíle. Výzkum v tomto projektu zaměřený na objasnění molekulární podstaty těchto jevů, bude mít dopad na pochopení lékové rezistence lidských nádorů a patogenních infekcí. Rentgenová krystalografie poskytuje strukturní informaci na atomové úrovni, které jsou zásadní pro pochopení funkce proteinu a racionální návrh účinných látek. Vedoucí projektu v každé partnerské zemi mají zkušenosti se studiem trojrozměrných struktur proteinů pomocí rentgenové krystalografie. Vědecké aktivity popsané v tomto návrhu jsou financovány v rámci národních projektů probíhajících v jednotlivých partnerských zemích. Budeme studovat následující tři třídy farmakologicky účinných enzymů na atomární úrovni pomocí rentgenové krystalografie a výpočetních metod: 1) endolyziny (Slovensko), 2) lidské karbonátlyázy (Česká republika) a 3) aldoketoreduktázy (Srbsko).
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10610 - Biophysics
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project was being realized in the framework of the MOBILITY Activity that aims primarily on establishing and strenghtening ties with foreign research institutions. The control of particular outputs is not implemented by the evalution committee, but the correctness of allocated finances and the adequacy of their use are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-MSM-8X-U/01:1
Data delivery date
Jun 18, 2019
Finance
Total approved costs
110 thou. CZK
Public financial support
110 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
110 CZK thou.
Public support
110 CZK thou.
0%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
CEP
BO - Biophysics
Solution period
01. 01. 2017 - 31. 12. 2018