Structural and biophysical basis of the reaction mechanism of intramembrane proteolysis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-09556S
Alternative language
Project name in Czech
Strukturní a biofyzikální podstata reakčního mechanismu intramembránové proteolysy
Annotation in Czech
Intramembránové proteasy (IMPR) regulují množství biologických procesů a jsou relevantní pro lidské choroby. V kontrastu s jejich významem a rozšířením jsou jen málo pochopeny mechanisticky. Krystalové struktury representativních IMPR ukázaly, že aktivní místa těchto enzymů jsou zanořená do membrány, ale tyto struktury nepřinesly porozumění principům rozlišování substrátů a dynamickým aspektům mechanismu. Využijeme rhomboidy jako modelové IMPR a kombinací enzymologie, rentgenové krystalografie, NMR spektroskopie s molekulárním modelováním a fluorescenčních metod (FRET-FLIM, FCS) budeme zkoumat interakce enzym-substrát, dimerisaci proteasy, konformační dynamiku substrátu, protonaci aktivního místa a jejich závislost na lipidovém prostředí. Tento komplexní přístup, pevně zakotven v našich předběžných výsledcích, rozkryje strukturní principy mechanismu IMPR z rodiny rhomboidů a vytvoří metodologický základ pro výzkum ostatních IMPR a transmembránových proteinů relevantních pro lidské choroby.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - another secondary branch
10620 - Other biological topics
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 24, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
8,212 thou. CZK
Public financial support
6,973 thou. CZK
Other public sources
1,239 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK