Genetically modified polymerases and their use for amplification of unpurified DNA
Public support
Provider
Ministry of Industry and Trade
Programme
TIP
Call for proposals
TIP 3 (SMPO2011/01)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
FR-TI3/067
Alternative language
Project name in Czech
Geneticky modifikované polymerázy a jejich využití pro amplifikaci nepurifikované DNA
Annotation in Czech
Kvantitativní polymerázová řetězcová reakce v reálném čase (qPCR) nabývá stále širšího uplatnění pro řadu analytických a diagnostických aplikací založených na amplifikaci DNA (nebo cDNA) fragmentů. qPCR má však své limitace, zvláště při amplifikaci obtížných templátů (např. GC bohaté fragmenty DNA o velikosti >800 párů bazí nebo použití DNA templátu z celé krve nebo dalších vzorků obsahujících inhibitory PCR). Cílem tohoto projektu je vyvinout nové generace přípravků pro amplifikaci "obtížných" DNA templátů. Důležitým experimentálním přístupem bude systematická analýza účinnosti qPCR směsí a výběr optimálních DNA vazebných barviv vhodných pro qPCR. Významnou součástí projektu bude příprava a výběr mutant Taq DNA polymerázy s novými vlastnostmi vhodnýmipro analýzu obtížně amplifikovatelných fragmentů DNA. Tyto nové reakční směsi budou dále optimalizovány pro účinnou amplifikaci za náročných podmínek.
Scientific branches
R&D category
VV - Exeperimental development
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
New mutants of Taq DNA polymerase were prepared which are capable to amplify in PCR DNA from whole blood (up to 20% of blood). These mutants represent new tools for DNA-based diagnosis with hihg commercial potential.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 3, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-MPO-FR-U/01:1
Data delivery date
Jul 3, 2015
Finance
Total approved costs
5,600 thou. CZK
Public financial support
4,400 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
1,200 thou. CZK