Super-resolution 3D BiplaneFPALM microscopy for mitochondrial morphology diagnostics of type 2 diabetes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-02033S
Alternative language
Project name in Czech
Superrozlišující třídimenzionální mikroskopie BiplaneFPALM pro mitochondriální morfologickou diagnostiku diabetu 2.typu
Annotation in Czech
Využijeme nové, v projektu AV ČR zkonstruované, aparatury BiplaneFPALM mikroskopu pro 3D fluorescenční fotoaktivační lokalizační mikroskopii (FPALM) se superrozlišením ~30 nm (1. v EU) a vylepšíme ji pro nalezení mitochondriální morfologické diagnostiky diabetu 2. typu. Zavedeme 3D imunohistochemii a 3D mitochondriální fluorescenční in situ hybridizaci (zobrazení DNA sekvence, FISH) v kombinaci s direct stochastic optical reconstruction microscopy (dSTORM) a ground state depletion imaging (GSDIM). Zobrazíme 3D struktury mitochondriální sítě existující se strukturou tzv. nukleoidů, tj. komplexů mitochondriální (mt) DNA s proteiny, u nichž prostudujeme jejich redistribuci při fragmentaci mitochondriální sítě zejména v souvislosti s mitofagií (s lysozomálními autofagosomy degradujícími malé objekty dezintegrované z mitochondriální sítě) a její deregulaci či zvýšení u diabetických beta buněk pankreatu Goto Kakizaki a kontrolních potkanů. Projekt spojí biofyziku s molekulární biologií a v prestižních publikacích objasní dosud neznámý mikrosvět mtDNA, mitofagie a etiologie diabetu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10610 - Biophysics<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project has upgraded the 3D stochastic fluorescence superresolution microscopy from the stage of physics basis and trials to the routine applications for solving relevant problems. The central result of the project is the discovery of cristae widening upon hypoxic adaptation monitored by using 3D FPALM a 3D dSTORM at simultaneous delocalization and clustering of Mic60/mitofilin protein.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
8,765 thou. CZK
Public financial support
8,765 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK