Mitochondrial DNA genetics in relation to mitochondrial network dynamics and pathogenesis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-12-1247
Alternative language
Project name in Czech
Genetika mitochondriální DNA ve vztahu k dynamice mitochondriální sítě a patogeneze
Annotation in Czech
3D 100nm/30nm rozlišující 4Pi a BiplaneFPALM mikroskopií, případně 2D STED a časovým konfokálním monitorováním rozlišíme mezi klidovým, transkripčním a replikačním stavem nukleoidů mitochondriální DNA (mtDNA), tedy komplexů několika molekul dvoušroubovicové cirkulární mtDNA a proteinů. Vizualizaci založíme na fluorescenčních a fotokonvertibilních proteinech (Eos, Dendra2, PAmCherry, a PA-CFP2) fúzovaných s proteiny nukleoidů (TFAM, ATAD3, Twinkle helikáza, mtSSB, TFBM, mTERF) případně na imunohistochemii u STED, u vybraných modelových buněk lentivirálně transfekovaných připravenými konstrukty. Prozkoumáme redistribuci mt nukleoidů ve vztahu k dezintegraci a fúzi mitochondriální sítě a buněčnému dělení ve vztahu mezi mateřskou a dceřinou buňkou; a rovněž vnitřní morfologii mt nukleoidů ve vztahu k hybridním strukturám DNA/RNA, výše zmíněným klidovým, transkripčním a replikačním stavům, a vybraným patologickým situacím. Nejméně prostudovaná část buněčné biologie tak bude prozkoumána na světově unikátním zařízení BiplaneFPALM mikroskopu zkonstruovaném ve spolupráci s Yale University.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
During this project, new information was obtained about the structure and dynamics of mitochodrial nucleoids under physiological and pathological conditions. The results of the project were published in 5 original papers and 1 review. Financial resources were used in conformity with the grant agency rules.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
7,635 thou. CZK
Public financial support
7,635 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK