Functional characterisation of identified novel candidate cell-fate influencing genes during pre-implantation mouse development
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-03295S
Alternative language
Project name in Czech
Funkční charakterizace nových kandidátních genů ovlivňujících buněčný osud u preimplantačního stádia vývoje myši
Annotation in Czech
Blastocysta savčího embrya se skládá ze tří základních buněčných typů: dvou diferencujících se extraembryonálních linií (trofektoderm a primitivní endoderm) a pluripotentní zárodečné linie budoucího plodu (epiblast). Stále fascinující nevyřešenou otázkou zůstává, jak se z jedné oplodněné vaječné buňky vyvine vysoce organizovaná mnohobuněčná blastocysta. Přesně řízená kontrola genové exprese a relativní pozice buněk (na povrchu versus uvnitř embrya) hrají pří tomto procesu významnou roli. Navrhujeme ověřit a funkčně charakterizovat nové kandidátské geny, které jsme našli na základě bioinformačních analýz publikovaných časových obrazovek mRNA exprese v embryu preimplantační myši. Zároveň plánujeme zjistit globální změny transkripce po umlčení exprese kandidátních genů pomocí RNAi (RNA-seq) a porovnat tato data s existujícími modely vzniku zárodečných linií v preimplantačním vývoji. Tento výzkum přinese důležité poznatky nejen embryologům v základním a klinickém výzkumu, ale může pomoci i budoucím terapiím využívajícím kmenové buňky.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The authors of this project characterized cellular mechanisms that govern the balance between pluripotent and differentiated cells in early mouse embryos. The main benefits that arise from this project are most applicable to the field of assisted reproductive technologies. The results were published in 3 primary research articles (mean IF=4,28) and one PhD Thesis that will be defended in 2017.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
6,889 thou. CZK
Public financial support
6,889 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK