Structural and functional components of plant telomeres
Project goals
Telomeres are nucleoprotein structures at the ends of eukaryotic chromosomes maintained by telomerase activity. Proposed project involves comprehensive studies of (i) protein structure and interactions of plant telomeres; (ii) telomerase complex regulation; and (iii) evolution of the telomerase protein subunit (TERT) gene structure. Protein components involved in the formation of functional plant telomere complex will be identified by high-throughput proteomic methods using model plants with different telomere length, Nicotiana tabacum and Arabidopsis thaliana. Candidate proteins will be further characterized using A. thaliana T-DNA insertion lines, and their interactions with telomere components (DNA-protein, protein-protein) will be investigated using conventional molecular-biology methods in vitro. Evolution of telomerase gene structure will be extended in polyploid species from the Nicotiana genus and the Solanaceae family. Expected project outcomes will enrich detailed understanding of regulation mechanisms of telomere maintenance.
Keywords
ArabidopsisevolutionchromatinpolyploidyregulationSolanaceaetelomeretelomerase
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-06943S
Alternative language
Project name in Czech
Strukturní a funkční komponenty rostlinných telomer
Annotation in Czech
Telomery jsou nukleoproteinové struktury na koncích eukaryotických chromosomů, které jsou udržovány aktivitou komplexu telomerázy. Předkládaný projekt v sobě zahrnuje komplexní studie (1) proteinové struktury a interakcí rostlinných telomer, (2) regulace komplexu telomerázy a (3) evoluce struktury genu TERT kódujícího proteinovou podjednotku telomerázy. Proteiny účastnící se tvorby funkčního komplexu rostlinné telomery budou identifikovány kombinací vysokokapacitních proteomických přístupů s využitím modelových rostlin s různou délkou telomer – Nicotiana tabacum a Arabidopsis thaliana. Kandidátní proteiny budou následně charakterizovány pomocí T-DNA inzerčních linií A. thaliana a jejich interakce (DNA-protein, protein-protein) s komponenty telomer budou zkoumány pomocí klasických molekulárně-biologických in vitro metod. Studie evoluce struktury telomerázového genu bude rozšířena o polyploidní druhy z rodu Nicotiana a čeledi Solanaceae. Očekávané výstupy projektu přispějí k detailnímu pochopení způsobů a regulace udržování telomer.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project solution proceeded in the intention of the project proposal and valuable original data were obtained in the fields of telomerase regulation in plant cells, evolution of genes coding protein part of telomerase reverse transcriptase (TERT) and in the identification of plant telomerase complex and its interacting partners. Project also substantially contributed to the educational process.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
19,576 thou. CZK
Public financial support
19,576 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
19 576 CZK thou.
Public support
19 576 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 02. 2013 - 31. 12. 2017