Biophysical analysis of DNA condensation. Effect of new organometallic compounds of biological significance.
Project goals
DNA condensation in vitro serves as a model system for many processes of physics, biochemistry and biology. Structures of several of metal-based agents of biological significance make it possible to predict that they can also condense DNA. To enhance our knowledge of the molecular and macromolecular level effects of antitumor and antibacterial agents, the effects of several new organometallic compounds on DNA condensation will be examined using the methods of molecular biophysics. The results of these studies will be correlated with antitumor or antibacterial effects of these compounds so that it will be possible to use this knowledge to underpin the process of designing new metallodrugs. Thus, data repositories of sufficient density and diversity will be obtained which will yield predictive capacities for assessing the origins of cellular “downstream” processes that result from interactions of DNA with DNA condensing agents.
Keywords
DNA condensationorganometallic compoundschromatin reconstitutionliquid crystalsAFMRamanantitumorantibacterial
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-08273S
Alternative language
Project name in Czech
Biofyzikální analýza kondenzace DNA. Efekt nových organokovových sloučenin s biologickou aktivitou.
Annotation in Czech
Kondenzace DNA in vitro slouží jako modelový systém pro řadu fyzikálních, biochemických a biologických procesů. Struktury některých sloučenin těžkých kovů, které mají biologický význam, umožňují předpovědět, že tyto látky mohou také vyvolat kondenzaci DNA. Abychom rozšířili dosavadní znalosti účinků protinádorových a antibakteriálních látek na molekulární a makromolekulární úrovni, budou studovány vlivy některých nových organokovových sloučenin na kondenzaci DNA, a to s využitím metod molekulární biofyziky. Výsledky těchto studií budou korelovány s protinádorovou a antibakteriální účinností těchto sloučenin a tak bude možné využít tyto znalosti na podporu procesu navrhování nových metalofarmak. Takto bude možné získat soubor dat dostatečné velikosti i rozmanitosti, který umožní využít prediktivních přístupů při stanovení příčin následných buněčných procesů, které jsou výsledkem interakce DNA s látkami kondenzujícími DNA.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project aimed at characterization of the interaction between DNA and metal-based compounds with antitumor and antibacterial activity. These compounds were proved to damage DNA causing condensation, which leads to severe biological effects. The obtained results of high significance were concluded in 5 contributions including 1 article in high ranked journal Angew. Chem. Int. Ed.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
5,414 thou. CZK
Public financial support
5,414 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
5 414 CZK thou.
Public support
5 414 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
BO - Biophysics
Solution period
01. 02. 2013 - 31. 12. 2016