Novel DNA and RNA oligonucleotides with Phosphonothioate and Phosphonoamidate Internucleotide Linkages.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta<br>Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-26526S
Alternative language
Project name in Czech
Nové DNA a RNA oligonukleotidy s fosfonothioátovými a fosfonoamidátovými internukleotidovými vazbami
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na syntézu strukturně diverzifikovaných izopolárních analogů oligonukleotidů (ON) s nukleázově stabilní internukleotidovou vazbou fosfonátového typu jako možných (i) nástrojů k ovlivnění exprese genomu (antisensní ON a siRNA), (ii) agonistů/antagonistů receptoru TLR9 (ON s CpG motivem) a (iii) efektorů tzv. 2-5A dráhy - agonistů/antagonistů RNasy L (2',5'-oligoriboadenyláty) a inhibitorů 2',5'-specifické fosfodiesterasy. Zásadní součástí projektu je syntéza monomerů – nukleosid-2'(3')- a 5'-fosfonátů/fosfinátů, jejichž inkorporace do DNA a RNA oligomerů, vede ke vzniku izosterních a neizosterních fosfonothioátových, fosfonoamidátových a fosfonothioamidátových internukleotidových vazeb, které nebyly dosud v ON studovány. Účinky připravených ON budou testovány in vitro na rekombinantních enzymech, tkáňových kulturách a na zvířecích modelech. Interakce ON budou studovány na molekulární úrovni spektrálními a teoretickými metodami a nové poznatky budou korelovány s biologickou aktivitou nových ON s cílem vědět více o vztazích mezi strukturou a biologickou aktivitou.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CC - Organic chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Modified oligonucleotides with a new types of phosphonate-based internucleotide linkages as compounds with terapeutic potential were synthesized; physico-chemical and biophysical evaluation and biological testing of modified oligonucleotides were performed. The aims of the project were accomplished; the results were published in 14 original papers and in 1 book chapter.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
11,970 thou. CZK
Public financial support
11,970 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK