Modified oligonucleotides derived from 5´-substituted nucleoside 5´-C-phosphonates: synthesis and hybridization properties
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Standardní projekty 7 (SGA02004GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Modifikované oligonukleotidy odvozené od 5´-substituovaných nukleosid-5´-C-fosfonátů: syntéza a hybridizační vlastnosti
Annotation in Czech
V rámci projektu budou připraveny modifikované oligonukleotidy obsahující 3´-O-P-CH(R)-5´´ internukleotidové vazby odvozené od 5´-substituovaných nukleosid-5´-C-fosfonátů, budou určeny jejich chemické a fyzikální vlastnosti a prokázán vliv 5´-substitucena hybridizační vlastnosti oligonukleotidů. Bude zjištěna především termodynamická stabilita komplexů získaných oligonukleotidů s přirozenými komplementárními řetězci a stabilita těchto oligonukleotidů vůči nukleolytickým enzymům. Projekt také zahrnuje (i) vypracování syntetických přístupů k novým typům 4´-a 5´-substituovaných 5´-C-fosfonátových analogů nukleotidů, které budou testovány na cytostatické a virostatické účinky ve spolupráci se zahraničními pracovišti a (ii) syntézu epimerně čistých 4´- a 5´-substituovaných 5´-C-fosfonátových monomerních jednotek pro oligonukleotidovou syntézu. Vybrané adeninové fosfonáty v ribořadě budou využity ke konstukci 2´-5´oligoadenylátů (trimerů a tetramerů) jako potenciálních aktivátorů ribonukleasy L.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CC - Organic chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Synthetic approaches leading to new epimeric pure monomeric units, the 2'-deoxynucleoside-5'-C-phosphonates with nucleobases T, CBz, ABz, GDBAM, were elaborated. Novel 4´- and 5´-substituted 5´-C-phosphonate analogs of nucleotides, e.g. 4´-methoxy, 5´-me
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GP-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
806 thou. CZK
Public financial support
806 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK