Anomeric D- and L-oligonucleotides with isopolar, isosteric internucleotide linkage: Synthesis, hybridization properties and spectroscopy
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta<br>Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Anomerní D- a L-oligonukleotidy s izopolární, izosterní fosfonátovou internukleotidovou vazbou: Syntéza, hybridizační vlastnosti a spektroskopie
Annotation in Czech
Hlavním cílem projektu je 1) studium nových reakcí na cukerném kruhu nukleosidu vedoucím k příslušným fosfonátovým analogům nukleotidů, 2) syntéza odpovídajících oligonukleotidů na pevné fázi a 3) studium základních fyzikálně-chemických a biologických vlastností modifikovaných oligonukleotidů. Detailněji se chemická část projektu zabývá přípravou C-substituovaných geminálních hydroxyfosfonátů a elektrofilní adicí těchto látek na anomerní 4, 5-didehydronukleosidy v D- i L-řadě. Vzniklé 4-C-fosfonomethoxynukleosidy substituované v poloze 5 budou transformovány na vhodně chráněné monomery pro fosfotriesterovou syntézu oligonukleotidů na pevné fázi. Připravené oligonukleotidy budou podrobeny komplexnímu studiu jejich fyzikálně chemických vlastností, zejména jejich hybridizačních schopností ve vztahu k typu fosfonátové vazby, se zřetelem k výběru kandidátů vhodných pro užití jako antisensní oligonukleotidy a aptamery.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CC - Organic chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Byly získány nové izosterní fosfonátové analogy aligothymidylátů. Klíčový vliv 4'-substituentů na hybridizační afinitu byl studován srovnáním s produkty vstřídných syntéz dvou nových typů stálejších oligomerů a fyzikálními metodami (MDS, Raman, NMR).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/AV0/AV02IA/U/N/7:3
Data delivery date
Jan 15, 2007
Finance
Total approved costs
5,127 thou. CZK
Public financial support
2,445 thou. CZK
Other public sources
2,682 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK