The novel type of oligonucleotides composed of pyrrolidine nucleosides and enzymaticaly stable phosphonate internucleotide bond
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Nový typ oligonukleotidů složených z pyrrolidinových nukleosidů a enzymaticky stabilní fosfonátové internukleotidové vazby
Annotation in Czech
V rámci projektu budou připraveny nové typy oligonukleotidů složených z pyrrolidinových nukleosidových jednotek a enzymaticky stále fosfonátové internukleotidové vazby (P-C) a budou určeny jejich chemické, fyzikální a biologické vlastnosti. Pro syntézutěchto oligonukleotidů na pevné fázi je třeba zvládnout syntézu vhodných monomerů. Klíčovou surovinou pro přípravu pyrrolidinových nukleosidů bude kyselina vinná, jež reakcí s vhodným primárním aminem poskytne žádaný pyrrolidinový prekurzor. Ten budenáslednou reakcí s nukleobasí transformován přes analog nukleosidu na odpovídající fosfonátový analog nukleotidu. K syntéze oligonukleotidů na pevné fázi bude použito modifikované triesterové metody. Připravené oligonukleotidy budou podrobeny fyzikálníma biochemickým studiím. Bude zjištěna především termodynamická stabilita duplexů získaných oligonukleotidů s přirozeným komplementárním řetězcem a stabilita těchto oligonukleotidů vůči nukleolytickým enzymům. Kromě hlavního cíle, tj. přípravy a ověření
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CC - Organic chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
A generál stratégy for the synthesis of pyrrolidine analogues of 3'-deoxy and 2',3'-dideoxynuclcosidcs starting from convenient chiral precursors (tartaric and malic acid) was developed. Using a set of phosphonylating agents, pyrrolidine phosphonate nucl
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GP-U/06:6
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
2,132 thou. CZK
Public financial support
704 thou. CZK
Other public sources
1,428 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK