Bridging microbial community ecology and degradation of xenobiotics – the use of metagenomics to investigate microbial degradation potential
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.<br>Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-28283S
Alternative language
Project name in Czech
Spojení ekologie mikrobiálních komunit a degradace xenobiotik - využití metagenomiky k analýze mikrobiálního degradačního potenciálu
Annotation in Czech
Rhizosféra je považována za centrální oblast interakcí rostlina-mikrob. V kontaminované zemině mají rostliny zvláštní význam – kořenové exudáty a látky uvolněné po odumření kořenů slouží jako růstové substráty pro mikroorganismy obývající rhizosféru a některé sekundární metabolity slouží jako induktory syntézy biodegradačních enzymů. Předkládaný projekt si klade za cíl studovat diversitu mikrobiálních (bakteriálních a fungálních) populací v rhizosféře rostlin přirozeně rostoucích v zemině kontaminované organickými polutanty (polychlorované bifenyly, dichlordifenyltrichlorethan, polycyklické aromatické uhlovodíky). Očekávané výsledky projektu objasní roli rostlin v utváření mikrobiálních komunit v kontaminované zemině, odhalí identitu bakterií a jejích degradačních genů, které za daných podmínek kontaminanty metabolizují, a osvětlí roli hub v biodegradaci těchto xenobiotik a mechanismy, kterými je biodegradace prováděna.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
DK - Contamination and decontamination of soil including pesticides
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10511 - Environmental sciences (social aspects to be 5.7)<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project contributed to understanding of microorganism diversity in contaminated soils, brought new information on bacteria and genes for degrading enzymes. Results may have practical applications. The objectives were fulfilled, the outcomes include 13 research papers, 3 reviews and several conference presentations.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 27, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
14,980 thou. CZK
Public financial support
14,980 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK