Analysis of microbial communities from different aquatic habitats: specific transcriptomics in relation to pollution by volatile organic compounds
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P504-10-0137
Alternative language
Project name in Czech
Analýza mikrobiálních komunit z různých vodních prostředí: specifická transkriptomika ve vztahu k znečištění způsobenému těkavými organickými látkami
Annotation in Czech
Cílem projektu je hlubší porozumění vztahu mezi znečištěním těkavými organickými látkami (VOCs) a aktivitou a různorodostí mikrobiálních genů souvisejících s biodegradací halogenovaných VOCs a epoxidů. Tento projekt mikrobiální ekologie spojuje specifickou environmentální transkriptomiku mikrobiálního společenství s množstvím VOCs ve vodním prostředí. Kontaminovaná a nekontaminovaná mikrobiální prostředí budou prozkoumána na výskyt vybraných VOCs, a tyto výsledky budou porovnány s analýzou mikrobiálníchtranskriptů genů kódujících haloalkándehalogenasy a epoxidhydrolasy, což jsou klíčové enzymy při biodegradaci halogenovaných VOCs a epoxidů. Celková mikrobiální společenství prozkoumaných míst budou analyzována určením sekvencí 16S rRNA a síly transkripce a rozmanitosti genů kódujících haloalkándehalogenasy a epoxidhydrolasy. Pomocí naši studie získáme také celkové specifické prokaryotické a eukaryotické geny aktivně zapojené do biodegradace halogenovaných VOCs a epoxidů v celkovém environmentálním mikrobiálním společenství.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EH - Ecology - communities
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aim of the project was the analysis of structure and functioning of natural bacterial communities from polluted sites. Both contaminants and microbial communities, plus sequences of the enzymes produced, were partly analysed. The project final reportis comprehensive and adequate.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Data delivery date
May 17, 2016
Finance
Total approved costs
2,289 thou. CZK
Public financial support
2,289 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK