Linking microbial meta-omics with ecosystem functioning: populations and pathways involved in chloroethenes degradation

Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Technická univerzita v Liberci / Ústav pro nanomateriály, pokročilé technologie a inovace<br>Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-32432S

Project name in Czech
Mikrobiální meta-omika v souvislosti s fungováním ekosystémů: role populací a jejich metabolických drah v degradaci chlorethenů
Annotation in Czech
Chlorované etyleny (CE) byly v 20. století hojně využívány jako účinná nehořlavá rozpouštědla, a proto nyní patří mezi nejčastější persistentní polutanty v půdách a podzemních vodách. Při degradaci CE dochází často k akumulaci toxičtějších meziproduktů, přičemž mechanismus jejich vzniku i odbourávání není stále uspokojivě objasněn. Naše studie propojuje informace o indigenních mikrobiálních populacích a jejich funkčních genech s metabolickou aktivitou během degradace CE. Moderní vysokokapacitní sekvenační metody v kombinaci s metodami funkční mikrobiální ekologie (např. stable isotope probing, SIP) umožní nový náhled do těchto dosud málo prozkoumaných mechanismů a vztahů. SIP selektuje tu část mikrobiálního společenstva, která se přímo podílí na asimilaci CE, meta–omika umožní detailní vhled do fungování společenstva s možností sledování nejen fylogenetické diversity (metagenomika), ale i funkčního rozlišení (metatranskriptomika, metaproteomika). Výsledkem projektu bude zmapování metabolických drah a aktivních genů zapojených do degradace CE v reálných podmínkách životního prostředí.

R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology

Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project goals were achieved. Anaerobic organohalide respiring bacteria at chlorinated ethenes contaminated sites were characterised and broad spectrum of molecular-genetic markers was introduced for description of present microbial communities. Results were published in six papers in international journals and in one national journal.

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019

Similar projects(10)