New genes for degradation of aromatic hydrocarbons in highly contaminated environment
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-23794S
Alternative language
Project name in Czech
Nové geny pro degradaci aromatických uhlovodíků ve vysoce kontaminovaném prostředí
Annotation in Czech
Projekt vychází z funkčního metagenomického přístupu, jímž se podaří zjistit jak v laboratorních podmínkách kultivovatelnou tak i nekultivovatelnou mikrobiální populaci specializovanou na aerobní degradaci aromatických sloučenin. Zaměření projektu je především orientováno na metagenomickou organizaci a diverzitu extradiolových dioxygenázových genů a dále na metabolické dráhy štěpící aromatická jádra v poloze meta, které jsou aktivní v prostředí vysoce kontaminovaném aromatickými a polyaromatickými uhlovodíky. Komplexní přístup bude aplikován pomocí vysokokapacitního sekvenování a analýzy metagenomových klonů a mikrobiálních komunit s aktivitou ke katecholu, funkční analýzy nových reprezentativních proteinů se specificitou k různým katecholovým substrátům, monitorování přežití genů během kultivací mesokozmů s půdou z kontaminovaných lokalit a pomocí mapování geografické distribuce izolovaných genů kódujících extradiolové dioxygenázy štěpící aromatická jádra.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
DK - Contamination and decontamination of soil including pesticides
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10511 - Environmental sciences (social aspects to be 5.7)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 4, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/13:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
5,871 thou. CZK
Public financial support
5,826 thou. CZK
Other public sources
45 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK