Evolution of holocentric chromosomes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-29362S
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce holocentrických chromosomů
Annotation in Czech
Adaptivní vznik holocentrických chromosomů (bez lokalizované centromery) jako obrany proti centromerickému tahu bude testován pomocí selekčních režimů působících na geny kinetochorových proteinů. K objasnění překvapivě negativní korelace 2C/2n a značné divergence velikostí a počtů holocentrických chromosomů je navržen nový evoluční mechanismus "holokinetický tah", který bude testován analýzou segregace fragmentovaných/nefragmentovaných homologů v potomstvu strukturálních heterozygotů připravených rentgenovým zářením. Velikost genomu a genomický obsah GC, proporce a efektivita jednotlivých mechanismů karyotypové evoluce (aneuploidie, polyploidie, fúze/fragmentace chromosomů, proliferace/odstraňování repetitivní DNA) budou analyzovány v holocentrických (Cyperaceae+Juncaceae, Chionographideae, Cuscuta subg. Cuscuta a Grammica, Drosera) a jejich sesterských monocentrických liniích pomocí průtokové cytometrie, počítání chromosomů a nově vyvinutého fylogentického algoritmu. Bude vyvinuta nová detekční technika pro masívní skríning holocentrismu u rostlin kombinující záření a cytometrii.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project was solved at very good level and all planned goals were reached. Important results were obtained on the evolution of holokinetic chromosomes in plants. A new flow cytometric method for detection of holokinetism was developed. The results were published in nine quality scientific journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
9,996 thou. CZK
Public financial support
9,996 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK