Interactions of p53 family proteins with biologically significant DNA quadruplexes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-36108S
Alternative language
Project name in Czech
Interakce proteinů rodiny p53 s biologicky významnými kvadruplexy DNA
Annotation in Czech
Pro funkci proteinů p53, p63 a p73 jako nádorových supresorů je rozhodující vazba na DNA. Pozoruhodná funkční flexibilita proteinu p53 (od regulace transkripce až po udržování genomové stability) souvisí s různými způsoby, kterými p53 s DNA interaguje. Lidský genom obsahuje sekvence DNA schopné tvořit guaninové (G-) kvadruplexy (např. repetitivní sekvence, promotory onkogenů, 5´UTR mRNA). V tomto projektu využijeme kombinace molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod k detekci a charakterizaci interakcí nádorových supresorů z rodiny p53 s DNA a RNA sekvencemi schopnými tvořít G-kvadruplexy v lidských telomerních motivech, trinukleotidových opakováních, promotorech vybraných genů (např. VEGF, hTERT, c-myc, EGR1) a 5´UTR mRNA. Tyto interakce budou paralelně studovány a srovnávány in vitro i in vivo. Pozornost bude zaměřena na biologické důsledky těchto interakcí, zejména na regulaci genové exprese.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
FD - Oncology and haematology
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project has been successfully solved. It brought the original results that are the answers on the questions (targets) originally declared in the project. The results indicate that they can be utilized for targeted therapy based on properties of p53 proteins. The results were published in 5 original papers in journal with IF. The reviewer evaluates the solving of the project as excellent.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 25, 2017
Finance
Total approved costs
4,919 thou. CZK
Public financial support
4,919 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK