Evolutionary factors of speciation and genomic diversification in host-parasite system.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-07004S
Alternative language
Project name in Czech
Evoluční faktory speciace a genomické diverzifikace a v systému parazit- hostitel.
Annotation in Czech
Projekt studuje vybrané evoluční procesy provázející diferenciaci populací a speciaci u dvou parazitických skupin (vši Polyplax serrata a prvoci rodu Eimeria), parazitujících u evropských druhů myšic rodu Apodemus. Na základě základních populačních a genealogických charakteristik a paternů, odhalených v předchozím projektu, se věnuje podrobnému studiu několika specifických problémů. Prostřednictvím genomového skenu se zaměřuje na získání informací o adaptivních změnách v genomu parazitů, jako komplementární informace k mapování variability MHC hostitelů, probíhající v současné době. Rozšířením souboru testovaných populací směrem na východ Evropy řeší otázku hostitelské specifity nově zjištěné linie eimerií s dosud úzce vymezenou specifitou k druhu A. agrarius. Nashromážděné údaje využívá také ke statistickému vyhodnocení možného vlivu jednoho z parazitických modelů na druhý, prostřednictvím hostitelské imunitní odpovědi..
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project led to significant, generally interesting results on the coevolution of parasites and hosts and met most of the objectives, although it encountered unexpected methodological difficulties. The results have so far been published only in a single paper in Genome Biology and Evolution, other manuscripts have not yet been accepted, but they have already been submitted.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Apr 23, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
5,681 thou. CZK
Public financial support
5,681 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK