Genomics and population genetics in host-parasite system: switches, diversification and adaptation
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-19831S
Alternative language
Project name in Czech
Genomika a populační genetika v systému parazit-hostitel: přeskoky, diverzifikace a adaptace
Annotation in Czech
Projekt se věnuje problematice hostitelské specifity a genetické diverzifikace v interakci hostitel-parazit, na základě našich výsledků získaných pomocí modelu myšic rodu Apodemus a jejich parazitů, vší rodu Polyplax a protozoí rodu Eimeria. Cílem je objasnit některé neobvyklé situace, pozorované ve studovaných populacích. U vší Polyplax je nejzajímavějším zjištěním striktní geografické oddělení dvou geneticky charakterizovaných populací, pocházejících z odlišných refugií, přičemž hostitelé těchto populací prošli výrazným genetickým míšením a jejich areály se překrývají v podstatné části Evropy. Kromě klasických teorií populační genetiky se budeme věnovat roli symbiotických bakterií jako možných původců genetické bariéry. Pro eimerie je nejvýraznějším případem rozporu mezi evoluční historií hostitele a parazita ztráta původní linie eimerií u druhu A.agrarius a druhotný zisk eimerií od skupiny A.flavicollis/sylvaticus. Tento přeskok proběhl velmi rychle a „přenesené haplotypy“ zcela vymizely z původních hostitelů. V projektu budeme zkoumat evoluční procesy podmiňující tyto změny.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
EH - Ecology - communities
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 26, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/11:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
8,863 thou. CZK
Public financial support
8,567 thou. CZK
Other public sources
296 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK