pre-mRNA structures in the regulation of gene expression in yeast
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-19002S
Alternative language
Project name in Czech
Struktury pre-mRNA v regulaci genové exprese u kvasinek
Annotation in Czech
Saccharomyces cerevisiae je mikroorganismem s klíčovým významem pro biotechnologie, stejně tak jako pro buněčnou biologii. Chceme prozkoumat roli intronů v regulaci genové exprese se zaměřením na geny kódující ribosomální proteiny (RPG). Publikovali jsme, že sestřih intronů s dlouhou vzdáleností mezi místem větvení (BP) a 3’ sestřihovým místem (3’ss) vyžaduje intramolekulární RNA strukturu. RPG většinou existují jako páry vysoce konzervovaných paralogů, jejich introny se však podstatně liší. Identifikovali jsme několik párů, ve kterých vždy jeden z paralogů nese intron s dlouhou vzdáleností mezi BP a 3’ss. Současné genomové studie odhalily existenci mezigenových regulačních obvodů, které kontrolují poměr koncentrací ribosomálních proteinů, produktů paralogních RPG. Chceme odhalit role, které sekvence a struktury v intronech hrají v mezigenových regulacích těchto genů. Budeme zkoumat, jak komunikují s ribosomálními proteiny a efektorovými komplexy metabolismu RNA. Máme za cíl určit význam intronových struktur pro odpověď kvasinek na stres a pro jejich fitness.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project brought new data concerning the regulatory mechanisms of production of ribosomal genes in yeast based on splicing of pre-mRNA. Working procedures were in agreement with the grant rules and aims of the project. Results have been published in 2 papers in journals with IF.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Apr 23, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 17, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
7,040 thou. CZK
Public financial support
7,040 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK