All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

pre-mRNA structures in the regulation of gene expression in yeast

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 18 (SGA0201400001)

  • Main participants

    Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    14-19002S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Struktury pre-mRNA v regulaci genové exprese u kvasinek

  • Annotation in Czech

    Saccharomyces cerevisiae je mikroorganismem s klíčovým významem pro biotechnologie, stejně tak jako pro buněčnou biologii. Chceme prozkoumat roli intronů v regulaci genové exprese se zaměřením na geny kódující ribosomální proteiny (RPG). Publikovali jsme, že sestřih intronů s dlouhou vzdáleností mezi místem větvení (BP) a 3’ sestřihovým místem (3’ss) vyžaduje intramolekulární RNA strukturu. RPG většinou existují jako páry vysoce konzervovaných paralogů, jejich introny se však podstatně liší. Identifikovali jsme několik párů, ve kterých vždy jeden z paralogů nese intron s dlouhou vzdáleností mezi BP a 3’ss. Současné genomové studie odhalily existenci mezigenových regulačních obvodů, které kontrolují poměr koncentrací ribosomálních proteinů, produktů paralogních RPG. Chceme odhalit role, které sekvence a struktury v intronech hrají v mezigenových regulacích těchto genů. Budeme zkoumat, jak komunikují s ribosomálními proteiny a efektorovými komplexy metabolismu RNA. Máme za cíl určit význam intronových struktur pro odpověď kvasinek na stres a pro jejich fitness.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EE - Microbiology, virology

  • CEP - secondary branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - another secondary branch

    EI - Biotechnology and bionics

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    The project brought new data concerning the regulatory mechanisms of production of ribosomal genes in yeast based on splicing of pre-mRNA. Working procedures were in agreement with the grant rules and aims of the project. Results have been published in 2 papers in journals with IF.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2014

  • Realization period - end

    Apr 23, 2018

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Mar 17, 2016

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP19-GA0-GA-U/01:1

  • Data delivery date

    Jun 12, 2019

Finance

  • Total approved costs

    7,040 thou. CZK

  • Public financial support

    7,040 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK